Protein–RNA interactions for Protein: P02671

FGA, Fibrinogen alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGAP02671 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FGAP02671 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FGAP02671 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FGAP02671 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FGAP02671 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FGAP02671 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FGAP02671 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FGAP02671 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FGAP02671 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
FGAP02671 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FGAP02671 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FGAP02671 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FGAP02671 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FGAP02671 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FGAP02671 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
FGAP02671 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FGAP02671 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FGAP02671 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FGAP02671 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FGAP02671 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FGAP02671 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FGAP02671 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FGAP02671 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FGAP02671 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FGAP02671 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FGAP02671 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FGAP02671 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
FGAP02671 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
FGAP02671 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FGAP02671 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
FGAP02671 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
FGAP02671 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FGAP02671 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FGAP02671 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FGAP02671 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FGAP02671 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FGAP02671 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FGAP02671 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FGAP02671 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FGAP02671 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FGAP02671 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FGAP02671 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FGAP02671 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FGAP02671 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FGAP02671 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FGAP02671 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FGAP02671 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FGAP02671 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FGAP02671 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FGAP02671 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FGAP02671 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FGAP02671 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FGAP02671 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FGAP02671 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FGAP02671 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FGAP02671 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FGAP02671 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FGAP02671 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
FGAP02671 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FGAP02671 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FGAP02671 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
FGAP02671 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FGAP02671 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FGAP02671 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FGAP02671 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FGAP02671 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FGAP02671 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FGAP02671 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
FGAP02671 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FGAP02671 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FGAP02671 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FGAP02671 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FGAP02671 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FGAP02671 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FGAP02671 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FGAP02671 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FGAP02671 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FGAP02671 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FGAP02671 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
FGAP02671 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FGAP02671 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FGAP02671 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FGAP02671 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FGAP02671 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FGAP02671 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FGAP02671 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FGAP02671 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FGAP02671 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FGAP02671 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FGAP02671 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FGAP02671 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FGAP02671 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FGAP02671 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FGAP02671 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FGAP02671 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FGAP02671 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FGAP02671 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FGAP02671 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FGAP02671 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FGAP02671 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms