Protein–RNA interactions for Protein: P02461

COL3A1, Collagen alpha-1(III) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL3A1P02461 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
COL3A1P02461 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
COL3A1P02461 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
COL3A1P02461 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
COL3A1P02461 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
COL3A1P02461 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
COL3A1P02461 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
COL3A1P02461 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
COL3A1P02461 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
COL3A1P02461 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
COL3A1P02461 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
COL3A1P02461 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
COL3A1P02461 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
COL3A1P02461 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
COL3A1P02461 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
COL3A1P02461 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
COL3A1P02461 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
COL3A1P02461 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
COL3A1P02461 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
COL3A1P02461 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
COL3A1P02461 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
COL3A1P02461 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
COL3A1P02461 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
COL3A1P02461 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
COL3A1P02461 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
COL3A1P02461 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
COL3A1P02461 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
COL3A1P02461 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
COL3A1P02461 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
COL3A1P02461 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
COL3A1P02461 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
COL3A1P02461 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
COL3A1P02461 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
COL3A1P02461 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
COL3A1P02461 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
COL3A1P02461 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
COL3A1P02461 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
COL3A1P02461 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
COL3A1P02461 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
COL3A1P02461 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
COL3A1P02461 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
COL3A1P02461 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC27■■□□□ 1.91
COL3A1P02461 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
COL3A1P02461 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
COL3A1P02461 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
COL3A1P02461 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
COL3A1P02461 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
COL3A1P02461 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
COL3A1P02461 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
COL3A1P02461 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
COL3A1P02461 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
COL3A1P02461 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
COL3A1P02461 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
COL3A1P02461 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
COL3A1P02461 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
COL3A1P02461 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
COL3A1P02461 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
COL3A1P02461 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
COL3A1P02461 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
COL3A1P02461 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
COL3A1P02461 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
COL3A1P02461 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC27■■□□□ 1.91
COL3A1P02461 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
COL3A1P02461 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC27■■□□□ 1.91
COL3A1P02461 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
COL3A1P02461 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
COL3A1P02461 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
COL3A1P02461 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
COL3A1P02461 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
COL3A1P02461 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
COL3A1P02461 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
COL3A1P02461 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
COL3A1P02461 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
COL3A1P02461 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
COL3A1P02461 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
COL3A1P02461 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
COL3A1P02461 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
COL3A1P02461 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
COL3A1P02461 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
COL3A1P02461 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
COL3A1P02461 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
COL3A1P02461 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
COL3A1P02461 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
COL3A1P02461 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
COL3A1P02461 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
COL3A1P02461 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
COL3A1P02461 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
COL3A1P02461 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
COL3A1P02461 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
COL3A1P02461 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
COL3A1P02461 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
COL3A1P02461 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
COL3A1P02461 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
COL3A1P02461 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
COL3A1P02461 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
COL3A1P02461 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
COL3A1P02461 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
COL3A1P02461 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
COL3A1P02461 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
COL3A1P02461 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms