Protein–RNA interactions for Protein: O95749

GGPS1, Geranylgeranyl pyrophosphate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGPS1O95749 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GGPS1O95749 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GGPS1O95749 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GGPS1O95749 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GGPS1O95749 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GGPS1O95749 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GGPS1O95749 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GGPS1O95749 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GGPS1O95749 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GGPS1O95749 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GGPS1O95749 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GGPS1O95749 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GGPS1O95749 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GGPS1O95749 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GGPS1O95749 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GGPS1O95749 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GGPS1O95749 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GGPS1O95749 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GGPS1O95749 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GGPS1O95749 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GGPS1O95749 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GGPS1O95749 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GGPS1O95749 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GGPS1O95749 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GGPS1O95749 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GGPS1O95749 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GGPS1O95749 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GGPS1O95749 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GGPS1O95749 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GGPS1O95749 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GGPS1O95749 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GGPS1O95749 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GGPS1O95749 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GGPS1O95749 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GGPS1O95749 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GGPS1O95749 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GGPS1O95749 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GGPS1O95749 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GGPS1O95749 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GGPS1O95749 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GGPS1O95749 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GGPS1O95749 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GGPS1O95749 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GGPS1O95749 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GGPS1O95749 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GGPS1O95749 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GGPS1O95749 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GGPS1O95749 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GGPS1O95749 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GGPS1O95749 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GGPS1O95749 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GGPS1O95749 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GGPS1O95749 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GGPS1O95749 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GGPS1O95749 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GGPS1O95749 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GGPS1O95749 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GGPS1O95749 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GGPS1O95749 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GGPS1O95749 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GGPS1O95749 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GGPS1O95749 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GGPS1O95749 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GGPS1O95749 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GGPS1O95749 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GGPS1O95749 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GGPS1O95749 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GGPS1O95749 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GGPS1O95749 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GGPS1O95749 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GGPS1O95749 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GGPS1O95749 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GGPS1O95749 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GGPS1O95749 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GGPS1O95749 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GGPS1O95749 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GGPS1O95749 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GGPS1O95749 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GGPS1O95749 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GGPS1O95749 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GGPS1O95749 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GGPS1O95749 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GGPS1O95749 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GGPS1O95749 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GGPS1O95749 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GGPS1O95749 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GGPS1O95749 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GGPS1O95749 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GGPS1O95749 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GGPS1O95749 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GGPS1O95749 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GGPS1O95749 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GGPS1O95749 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GGPS1O95749 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GGPS1O95749 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GGPS1O95749 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GGPS1O95749 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GGPS1O95749 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GGPS1O95749 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GGPS1O95749 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms