Protein–RNA interactions for Protein: O95202

LETM1, Mitochondrial proton/calcium exchanger protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 739 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM1O95202 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LETM1O95202 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LETM1O95202 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LETM1O95202 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LETM1O95202 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LETM1O95202 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LETM1O95202 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LETM1O95202 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LETM1O95202 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LETM1O95202 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LETM1O95202 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LETM1O95202 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LETM1O95202 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LETM1O95202 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LETM1O95202 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
LETM1O95202 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LETM1O95202 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LETM1O95202 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LETM1O95202 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LETM1O95202 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LETM1O95202 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LETM1O95202 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LETM1O95202 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LETM1O95202 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LETM1O95202 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LETM1O95202 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LETM1O95202 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LETM1O95202 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LETM1O95202 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LETM1O95202 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LETM1O95202 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LETM1O95202 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LETM1O95202 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LETM1O95202 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LETM1O95202 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LETM1O95202 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LETM1O95202 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
LETM1O95202 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LETM1O95202 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LETM1O95202 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LETM1O95202 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LETM1O95202 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LETM1O95202 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LETM1O95202 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LETM1O95202 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LETM1O95202 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LETM1O95202 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LETM1O95202 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LETM1O95202 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LETM1O95202 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LETM1O95202 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LETM1O95202 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LETM1O95202 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LETM1O95202 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LETM1O95202 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LETM1O95202 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LETM1O95202 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LETM1O95202 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LETM1O95202 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LETM1O95202 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LETM1O95202 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LETM1O95202 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LETM1O95202 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LETM1O95202 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LETM1O95202 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LETM1O95202 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LETM1O95202 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LETM1O95202 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LETM1O95202 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LETM1O95202 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LETM1O95202 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LETM1O95202 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LETM1O95202 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LETM1O95202 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LETM1O95202 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LETM1O95202 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LETM1O95202 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LETM1O95202 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LETM1O95202 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LETM1O95202 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LETM1O95202 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LETM1O95202 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LETM1O95202 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LETM1O95202 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
LETM1O95202 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LETM1O95202 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LETM1O95202 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LETM1O95202 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LETM1O95202 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LETM1O95202 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LETM1O95202 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LETM1O95202 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LETM1O95202 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
LETM1O95202 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LETM1O95202 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
LETM1O95202 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LETM1O95202 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LETM1O95202 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
LETM1O95202 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LETM1O95202 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms