Protein–RNA interactions for Protein: O75920

SERF1A, Small EDRK-rich factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERF1AO75920 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SERF1AO75920 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SERF1AO75920 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SERF1AO75920 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SERF1AO75920 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SERF1AO75920 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SERF1AO75920 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SERF1AO75920 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SERF1AO75920 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SERF1AO75920 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SERF1AO75920 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SERF1AO75920 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SERF1AO75920 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SERF1AO75920 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SERF1AO75920 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SERF1AO75920 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SERF1AO75920 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SERF1AO75920 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SERF1AO75920 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SERF1AO75920 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SERF1AO75920 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SERF1AO75920 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SERF1AO75920 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SERF1AO75920 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SERF1AO75920 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SERF1AO75920 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SERF1AO75920 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SERF1AO75920 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SERF1AO75920 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SERF1AO75920 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERF1AO75920 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SERF1AO75920 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SERF1AO75920 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERF1AO75920 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SERF1AO75920 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERF1AO75920 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SERF1AO75920 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERF1AO75920 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERF1AO75920 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERF1AO75920 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SERF1AO75920 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERF1AO75920 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SERF1AO75920 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SERF1AO75920 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERF1AO75920 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERF1AO75920 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERF1AO75920 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERF1AO75920 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERF1AO75920 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SERF1AO75920 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SERF1AO75920 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SERF1AO75920 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERF1AO75920 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERF1AO75920 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERF1AO75920 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERF1AO75920 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERF1AO75920 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERF1AO75920 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SERF1AO75920 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERF1AO75920 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SERF1AO75920 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERF1AO75920 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERF1AO75920 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERF1AO75920 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SERF1AO75920 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERF1AO75920 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERF1AO75920 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERF1AO75920 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SERF1AO75920 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SERF1AO75920 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SERF1AO75920 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SERF1AO75920 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SERF1AO75920 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SERF1AO75920 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SERF1AO75920 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SERF1AO75920 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SERF1AO75920 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SERF1AO75920 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SERF1AO75920 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SERF1AO75920 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SERF1AO75920 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SERF1AO75920 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SERF1AO75920 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SERF1AO75920 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SERF1AO75920 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SERF1AO75920 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SERF1AO75920 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SERF1AO75920 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SERF1AO75920 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SERF1AO75920 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SERF1AO75920 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SERF1AO75920 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SERF1AO75920 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SERF1AO75920 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SERF1AO75920 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SERF1AO75920 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SERF1AO75920 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SERF1AO75920 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SERF1AO75920 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SERF1AO75920 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms