Protein–RNA interactions for Protein: O75335

PPFIA4, Liprin-alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA4O75335 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPFIA4O75335 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPFIA4O75335 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPFIA4O75335 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPFIA4O75335 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPFIA4O75335 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPFIA4O75335 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPFIA4O75335 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPFIA4O75335 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPFIA4O75335 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PPFIA4O75335 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPFIA4O75335 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPFIA4O75335 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPFIA4O75335 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPFIA4O75335 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPFIA4O75335 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPFIA4O75335 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPFIA4O75335 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPFIA4O75335 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPFIA4O75335 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPFIA4O75335 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPFIA4O75335 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPFIA4O75335 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPFIA4O75335 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPFIA4O75335 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPFIA4O75335 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPFIA4O75335 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPFIA4O75335 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPFIA4O75335 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPFIA4O75335 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPFIA4O75335 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPFIA4O75335 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPFIA4O75335 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPFIA4O75335 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPFIA4O75335 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPFIA4O75335 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPFIA4O75335 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPFIA4O75335 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPFIA4O75335 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPFIA4O75335 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPFIA4O75335 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPFIA4O75335 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PPFIA4O75335 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPFIA4O75335 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PPFIA4O75335 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPFIA4O75335 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPFIA4O75335 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PPFIA4O75335 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPFIA4O75335 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPFIA4O75335 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPFIA4O75335 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPFIA4O75335 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPFIA4O75335 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPFIA4O75335 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPFIA4O75335 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPFIA4O75335 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPFIA4O75335 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PPFIA4O75335 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPFIA4O75335 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PPFIA4O75335 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPFIA4O75335 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPFIA4O75335 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPFIA4O75335 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPFIA4O75335 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPFIA4O75335 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPFIA4O75335 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPFIA4O75335 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPFIA4O75335 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPFIA4O75335 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPFIA4O75335 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPFIA4O75335 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPFIA4O75335 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPFIA4O75335 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPFIA4O75335 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPFIA4O75335 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPFIA4O75335 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPFIA4O75335 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPFIA4O75335 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPFIA4O75335 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPFIA4O75335 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPFIA4O75335 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPFIA4O75335 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPFIA4O75335 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPFIA4O75335 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPFIA4O75335 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPFIA4O75335 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPFIA4O75335 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPFIA4O75335 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPFIA4O75335 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPFIA4O75335 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPFIA4O75335 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPFIA4O75335 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPFIA4O75335 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPFIA4O75335 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPFIA4O75335 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPFIA4O75335 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPFIA4O75335 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPFIA4O75335 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPFIA4O75335 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPFIA4O75335 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms