Protein–RNA interactions for Protein: O75164

KDM4A, Lysine-specific demethylase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4AO75164 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
KDM4AO75164 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KDM4AO75164 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KDM4AO75164 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KDM4AO75164 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KDM4AO75164 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KDM4AO75164 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KDM4AO75164 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KDM4AO75164 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM4AO75164 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM4AO75164 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM4AO75164 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM4AO75164 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM4AO75164 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM4AO75164 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM4AO75164 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM4AO75164 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM4AO75164 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM4AO75164 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM4AO75164 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM4AO75164 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM4AO75164 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM4AO75164 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM4AO75164 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM4AO75164 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM4AO75164 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM4AO75164 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KDM4AO75164 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KDM4AO75164 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KDM4AO75164 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KDM4AO75164 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
KDM4AO75164 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
KDM4AO75164 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KDM4AO75164 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KDM4AO75164 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KDM4AO75164 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KDM4AO75164 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KDM4AO75164 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KDM4AO75164 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM4AO75164 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM4AO75164 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM4AO75164 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM4AO75164 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM4AO75164 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM4AO75164 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM4AO75164 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM4AO75164 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM4AO75164 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM4AO75164 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM4AO75164 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM4AO75164 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM4AO75164 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM4AO75164 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM4AO75164 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM4AO75164 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM4AO75164 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM4AO75164 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM4AO75164 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM4AO75164 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM4AO75164 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM4AO75164 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM4AO75164 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM4AO75164 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM4AO75164 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM4AO75164 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM4AO75164 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM4AO75164 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM4AO75164 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM4AO75164 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM4AO75164 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM4AO75164 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM4AO75164 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM4AO75164 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM4AO75164 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM4AO75164 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM4AO75164 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM4AO75164 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM4AO75164 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM4AO75164 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM4AO75164 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM4AO75164 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM4AO75164 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM4AO75164 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM4AO75164 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM4AO75164 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM4AO75164 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM4AO75164 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM4AO75164 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM4AO75164 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM4AO75164 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM4AO75164 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM4AO75164 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM4AO75164 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KDM4AO75164 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
KDM4AO75164 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
KDM4AO75164 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KDM4AO75164 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
KDM4AO75164 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KDM4AO75164 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KDM4AO75164 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms