Protein–RNA interactions for Protein: O75161

NPHP4, Nephrocystin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP4O75161 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NPHP4O75161 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NPHP4O75161 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NPHP4O75161 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
NPHP4O75161 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
NPHP4O75161 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
NPHP4O75161 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
NPHP4O75161 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
NPHP4O75161 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NPHP4O75161 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NPHP4O75161 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NPHP4O75161 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NPHP4O75161 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NPHP4O75161 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NPHP4O75161 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NPHP4O75161 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NPHP4O75161 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NPHP4O75161 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NPHP4O75161 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NPHP4O75161 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NPHP4O75161 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
NPHP4O75161 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NPHP4O75161 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NPHP4O75161 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NPHP4O75161 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NPHP4O75161 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NPHP4O75161 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
NPHP4O75161 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NPHP4O75161 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
NPHP4O75161 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NPHP4O75161 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NPHP4O75161 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NPHP4O75161 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NPHP4O75161 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NPHP4O75161 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NPHP4O75161 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
NPHP4O75161 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NPHP4O75161 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NPHP4O75161 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
NPHP4O75161 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NPHP4O75161 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
NPHP4O75161 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NPHP4O75161 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NPHP4O75161 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NPHP4O75161 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NPHP4O75161 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NPHP4O75161 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NPHP4O75161 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NPHP4O75161 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NPHP4O75161 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
NPHP4O75161 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NPHP4O75161 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NPHP4O75161 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NPHP4O75161 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NPHP4O75161 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NPHP4O75161 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NPHP4O75161 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NPHP4O75161 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NPHP4O75161 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NPHP4O75161 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NPHP4O75161 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NPHP4O75161 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NPHP4O75161 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NPHP4O75161 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
NPHP4O75161 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NPHP4O75161 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NPHP4O75161 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NPHP4O75161 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NPHP4O75161 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
NPHP4O75161 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NPHP4O75161 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NPHP4O75161 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NPHP4O75161 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NPHP4O75161 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NPHP4O75161 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
NPHP4O75161 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NPHP4O75161 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NPHP4O75161 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NPHP4O75161 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NPHP4O75161 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NPHP4O75161 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NPHP4O75161 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NPHP4O75161 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NPHP4O75161 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
NPHP4O75161 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NPHP4O75161 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NPHP4O75161 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NPHP4O75161 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NPHP4O75161 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NPHP4O75161 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NPHP4O75161 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NPHP4O75161 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NPHP4O75161 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
NPHP4O75161 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NPHP4O75161 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
NPHP4O75161 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NPHP4O75161 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NPHP4O75161 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NPHP4O75161 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NPHP4O75161 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms