Protein–RNA interactions for Protein: O75110

ATP9A, Probable phospholipid-transporting ATPase IIA, humanhuman

Predictions only

Length 1,047 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9AO75110 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP9AO75110 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP9AO75110 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP9AO75110 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP9AO75110 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP9AO75110 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP9AO75110 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP9AO75110 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP9AO75110 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP9AO75110 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP9AO75110 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP9AO75110 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP9AO75110 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP9AO75110 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP9AO75110 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP9AO75110 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP9AO75110 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP9AO75110 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP9AO75110 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP9AO75110 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP9AO75110 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP9AO75110 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP9AO75110 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP9AO75110 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP9AO75110 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP9AO75110 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP9AO75110 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP9AO75110 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP9AO75110 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP9AO75110 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP9AO75110 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP9AO75110 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP9AO75110 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP9AO75110 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP9AO75110 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP9AO75110 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP9AO75110 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP9AO75110 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP9AO75110 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP9AO75110 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP9AO75110 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP9AO75110 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP9AO75110 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP9AO75110 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP9AO75110 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP9AO75110 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP9AO75110 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP9AO75110 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP9AO75110 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP9AO75110 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP9AO75110 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP9AO75110 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP9AO75110 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP9AO75110 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP9AO75110 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATP9AO75110 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATP9AO75110 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATP9AO75110 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP9AO75110 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP9AO75110 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP9AO75110 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP9AO75110 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP9AO75110 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP9AO75110 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP9AO75110 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP9AO75110 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP9AO75110 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP9AO75110 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP9AO75110 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP9AO75110 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP9AO75110 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP9AO75110 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP9AO75110 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP9AO75110 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP9AO75110 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP9AO75110 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP9AO75110 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP9AO75110 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP9AO75110 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP9AO75110 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP9AO75110 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP9AO75110 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP9AO75110 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP9AO75110 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP9AO75110 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP9AO75110 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP9AO75110 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP9AO75110 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP9AO75110 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP9AO75110 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP9AO75110 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP9AO75110 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP9AO75110 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP9AO75110 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP9AO75110 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP9AO75110 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP9AO75110 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP9AO75110 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP9AO75110 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP9AO75110 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms