Protein–RNA interactions for Protein: O60934

NBN, Nibrin, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBNO60934 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NBNO60934 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NBNO60934 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NBNO60934 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NBNO60934 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NBNO60934 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NBNO60934 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NBNO60934 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NBNO60934 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NBNO60934 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NBNO60934 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NBNO60934 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NBNO60934 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NBNO60934 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NBNO60934 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NBNO60934 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NBNO60934 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NBNO60934 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NBNO60934 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NBNO60934 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NBNO60934 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NBNO60934 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NBNO60934 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NBNO60934 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NBNO60934 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NBNO60934 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NBNO60934 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NBNO60934 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NBNO60934 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NBNO60934 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NBNO60934 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NBNO60934 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NBNO60934 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NBNO60934 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NBNO60934 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NBNO60934 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NBNO60934 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NBNO60934 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NBNO60934 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NBNO60934 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NBNO60934 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NBNO60934 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NBNO60934 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NBNO60934 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NBNO60934 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NBNO60934 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NBNO60934 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NBNO60934 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NBNO60934 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NBNO60934 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NBNO60934 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NBNO60934 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NBNO60934 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NBNO60934 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NBNO60934 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NBNO60934 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NBNO60934 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NBNO60934 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NBNO60934 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NBNO60934 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NBNO60934 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NBNO60934 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NBNO60934 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NBNO60934 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NBNO60934 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NBNO60934 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NBNO60934 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NBNO60934 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NBNO60934 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NBNO60934 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NBNO60934 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NBNO60934 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NBNO60934 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NBNO60934 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NBNO60934 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NBNO60934 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NBNO60934 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NBNO60934 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NBNO60934 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NBNO60934 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NBNO60934 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NBNO60934 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NBNO60934 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NBNO60934 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NBNO60934 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NBNO60934 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NBNO60934 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NBNO60934 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NBNO60934 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NBNO60934 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NBNO60934 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NBNO60934 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NBNO60934 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NBNO60934 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NBNO60934 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NBNO60934 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NBNO60934 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NBNO60934 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NBNO60934 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NBNO60934 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms