Protein–RNA interactions for Protein: O60763

USO1, General vesicular transport factor p115, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USO1O60763 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USO1O60763 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USO1O60763 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USO1O60763 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USO1O60763 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USO1O60763 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USO1O60763 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USO1O60763 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USO1O60763 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USO1O60763 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USO1O60763 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USO1O60763 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USO1O60763 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USO1O60763 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USO1O60763 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USO1O60763 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USO1O60763 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USO1O60763 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USO1O60763 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USO1O60763 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
USO1O60763 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
USO1O60763 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USO1O60763 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USO1O60763 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USO1O60763 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USO1O60763 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USO1O60763 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USO1O60763 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USO1O60763 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USO1O60763 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USO1O60763 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USO1O60763 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USO1O60763 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USO1O60763 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USO1O60763 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USO1O60763 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USO1O60763 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USO1O60763 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USO1O60763 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USO1O60763 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USO1O60763 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USO1O60763 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USO1O60763 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USO1O60763 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USO1O60763 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USO1O60763 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USO1O60763 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USO1O60763 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USO1O60763 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USO1O60763 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USO1O60763 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USO1O60763 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USO1O60763 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USO1O60763 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USO1O60763 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USO1O60763 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USO1O60763 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USO1O60763 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USO1O60763 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USO1O60763 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USO1O60763 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
USO1O60763 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USO1O60763 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USO1O60763 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USO1O60763 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USO1O60763 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USO1O60763 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USO1O60763 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USO1O60763 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USO1O60763 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USO1O60763 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USO1O60763 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USO1O60763 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USO1O60763 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USO1O60763 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USO1O60763 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USO1O60763 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USO1O60763 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USO1O60763 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
USO1O60763 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
USO1O60763 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USO1O60763 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USO1O60763 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
USO1O60763 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USO1O60763 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USO1O60763 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USO1O60763 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USO1O60763 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USO1O60763 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USO1O60763 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USO1O60763 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USO1O60763 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
USO1O60763 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USO1O60763 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USO1O60763 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USO1O60763 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USO1O60763 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USO1O60763 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
USO1O60763 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
USO1O60763 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms