Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
DENRO43583 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
DENRO43583 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
DENRO43583 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
DENRO43583 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
DENRO43583 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DENRO43583 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DENRO43583 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DENRO43583 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DENRO43583 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DENRO43583 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DENRO43583 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
DENRO43583 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DENRO43583 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DENRO43583 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DENRO43583 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DENRO43583 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
DENRO43583 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
DENRO43583 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
DENRO43583 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DENRO43583 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
DENRO43583 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DENRO43583 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DENRO43583 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DENRO43583 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DENRO43583 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DENRO43583 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DENRO43583 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DENRO43583 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DENRO43583 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DENRO43583 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DENRO43583 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DENRO43583 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DENRO43583 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DENRO43583 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DENRO43583 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
DENRO43583 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DENRO43583 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DENRO43583 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DENRO43583 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DENRO43583 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DENRO43583 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DENRO43583 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DENRO43583 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DENRO43583 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DENRO43583 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DENRO43583 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DENRO43583 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DENRO43583 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DENRO43583 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DENRO43583 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DENRO43583 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DENRO43583 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
DENRO43583 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DENRO43583 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
DENRO43583 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
DENRO43583 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
DENRO43583 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DENRO43583 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DENRO43583 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DENRO43583 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DENRO43583 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DENRO43583 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
DENRO43583 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DENRO43583 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DENRO43583 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DENRO43583 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DENRO43583 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DENRO43583 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DENRO43583 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DENRO43583 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DENRO43583 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DENRO43583 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
DENRO43583 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
DENRO43583 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DENRO43583 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DENRO43583 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DENRO43583 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DENRO43583 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DENRO43583 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DENRO43583 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DENRO43583 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DENRO43583 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DENRO43583 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DENRO43583 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DENRO43583 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DENRO43583 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DENRO43583 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DENRO43583 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DENRO43583 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DENRO43583 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DENRO43583 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DENRO43583 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DENRO43583 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
DENRO43583 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DENRO43583 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DENRO43583 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DENRO43583 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DENRO43583 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DENRO43583 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms