Protein–RNA interactions for Protein: O43237

DYNC1LI2, Cytoplasmic dynein 1 light intermediate chain 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYNC1LI2O43237 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DYNC1LI2O43237 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DYNC1LI2O43237 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DYNC1LI2O43237 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DYNC1LI2O43237 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DYNC1LI2O43237 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DYNC1LI2O43237 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DYNC1LI2O43237 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DYNC1LI2O43237 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DYNC1LI2O43237 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DYNC1LI2O43237 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DYNC1LI2O43237 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
DYNC1LI2O43237 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DYNC1LI2O43237 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DYNC1LI2O43237 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DYNC1LI2O43237 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DYNC1LI2O43237 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
DYNC1LI2O43237 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DYNC1LI2O43237 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DYNC1LI2O43237 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DYNC1LI2O43237 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DYNC1LI2O43237 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DYNC1LI2O43237 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DYNC1LI2O43237 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DYNC1LI2O43237 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DYNC1LI2O43237 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DYNC1LI2O43237 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DYNC1LI2O43237 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DYNC1LI2O43237 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DYNC1LI2O43237 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DYNC1LI2O43237 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
DYNC1LI2O43237 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DYNC1LI2O43237 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DYNC1LI2O43237 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DYNC1LI2O43237 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DYNC1LI2O43237 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DYNC1LI2O43237 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DYNC1LI2O43237 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DYNC1LI2O43237 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DYNC1LI2O43237 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DYNC1LI2O43237 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DYNC1LI2O43237 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DYNC1LI2O43237 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DYNC1LI2O43237 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DYNC1LI2O43237 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DYNC1LI2O43237 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DYNC1LI2O43237 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DYNC1LI2O43237 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DYNC1LI2O43237 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DYNC1LI2O43237 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
DYNC1LI2O43237 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DYNC1LI2O43237 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DYNC1LI2O43237 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DYNC1LI2O43237 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DYNC1LI2O43237 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DYNC1LI2O43237 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DYNC1LI2O43237 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DYNC1LI2O43237 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DYNC1LI2O43237 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DYNC1LI2O43237 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DYNC1LI2O43237 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DYNC1LI2O43237 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DYNC1LI2O43237 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DYNC1LI2O43237 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DYNC1LI2O43237 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DYNC1LI2O43237 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DYNC1LI2O43237 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DYNC1LI2O43237 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DYNC1LI2O43237 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DYNC1LI2O43237 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DYNC1LI2O43237 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DYNC1LI2O43237 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DYNC1LI2O43237 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DYNC1LI2O43237 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DYNC1LI2O43237 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DYNC1LI2O43237 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DYNC1LI2O43237 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DYNC1LI2O43237 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
DYNC1LI2O43237 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DYNC1LI2O43237 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DYNC1LI2O43237 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DYNC1LI2O43237 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DYNC1LI2O43237 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DYNC1LI2O43237 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DYNC1LI2O43237 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DYNC1LI2O43237 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DYNC1LI2O43237 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DYNC1LI2O43237 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DYNC1LI2O43237 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DYNC1LI2O43237 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DYNC1LI2O43237 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DYNC1LI2O43237 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DYNC1LI2O43237 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DYNC1LI2O43237 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DYNC1LI2O43237 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DYNC1LI2O43237 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
DYNC1LI2O43237 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
DYNC1LI2O43237 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DYNC1LI2O43237 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DYNC1LI2O43237 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms