Protein–RNA interactions for Protein: O00505

KPNA3, Importin subunit alpha-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA3O00505 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KPNA3O00505 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KPNA3O00505 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KPNA3O00505 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KPNA3O00505 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KPNA3O00505 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KPNA3O00505 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KPNA3O00505 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KPNA3O00505 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KPNA3O00505 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KPNA3O00505 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KPNA3O00505 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KPNA3O00505 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KPNA3O00505 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KPNA3O00505 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KPNA3O00505 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
KPNA3O00505 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KPNA3O00505 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KPNA3O00505 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
KPNA3O00505 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
KPNA3O00505 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KPNA3O00505 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KPNA3O00505 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KPNA3O00505 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KPNA3O00505 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KPNA3O00505 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KPNA3O00505 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KPNA3O00505 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KPNA3O00505 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KPNA3O00505 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KPNA3O00505 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KPNA3O00505 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KPNA3O00505 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
KPNA3O00505 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KPNA3O00505 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
KPNA3O00505 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KPNA3O00505 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KPNA3O00505 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
KPNA3O00505 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KPNA3O00505 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KPNA3O00505 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KPNA3O00505 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KPNA3O00505 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KPNA3O00505 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KPNA3O00505 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KPNA3O00505 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KPNA3O00505 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KPNA3O00505 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KPNA3O00505 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KPNA3O00505 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KPNA3O00505 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KPNA3O00505 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
KPNA3O00505 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KPNA3O00505 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KPNA3O00505 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
KPNA3O00505 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KPNA3O00505 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KPNA3O00505 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KPNA3O00505 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KPNA3O00505 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KPNA3O00505 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KPNA3O00505 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KPNA3O00505 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KPNA3O00505 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KPNA3O00505 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KPNA3O00505 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KPNA3O00505 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KPNA3O00505 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KPNA3O00505 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KPNA3O00505 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KPNA3O00505 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KPNA3O00505 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KPNA3O00505 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KPNA3O00505 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KPNA3O00505 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KPNA3O00505 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KPNA3O00505 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KPNA3O00505 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
KPNA3O00505 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KPNA3O00505 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KPNA3O00505 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KPNA3O00505 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KPNA3O00505 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KPNA3O00505 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KPNA3O00505 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KPNA3O00505 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KPNA3O00505 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KPNA3O00505 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KPNA3O00505 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KPNA3O00505 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KPNA3O00505 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KPNA3O00505 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KPNA3O00505 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KPNA3O00505 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KPNA3O00505 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KPNA3O00505 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KPNA3O00505 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KPNA3O00505 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KPNA3O00505 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KPNA3O00505 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms