Protein–RNA interactions for Protein: J3KT08

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KT08 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
J3KT08 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
J3KT08 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
J3KT08 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
J3KT08 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
J3KT08 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
J3KT08 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
J3KT08 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
J3KT08 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
J3KT08 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
J3KT08 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
J3KT08 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
J3KT08 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
J3KT08 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
J3KT08 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
J3KT08 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
J3KT08 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
J3KT08 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
J3KT08 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
J3KT08 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
J3KT08 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
J3KT08 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
J3KT08 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
J3KT08 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
J3KT08 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
J3KT08 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
J3KT08 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
J3KT08 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
J3KT08 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
J3KT08 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
J3KT08 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
J3KT08 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
J3KT08 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
J3KT08 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
J3KT08 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
J3KT08 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
J3KT08 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
J3KT08 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
J3KT08 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
J3KT08 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
J3KT08 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
J3KT08 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
J3KT08 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
J3KT08 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
J3KT08 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
J3KT08 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
J3KT08 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
J3KT08 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
J3KT08 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
J3KT08 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
J3KT08 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
J3KT08 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
J3KT08 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
J3KT08 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
J3KT08 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
J3KT08 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
J3KT08 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
J3KT08 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
J3KT08 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
J3KT08 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
J3KT08 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
J3KT08 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
J3KT08 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
J3KT08 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
J3KT08 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
J3KT08 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
J3KT08 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
J3KT08 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
J3KT08 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
J3KT08 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
J3KT08 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
J3KT08 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
J3KT08 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
J3KT08 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
J3KT08 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
J3KT08 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
J3KT08 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
J3KT08 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
J3KT08 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
J3KT08 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
J3KT08 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
J3KT08 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
J3KT08 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
J3KT08 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
J3KT08 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
J3KT08 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
J3KT08 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
J3KT08 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
J3KT08 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
J3KT08 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
J3KT08 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
J3KT08 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
J3KT08 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
J3KT08 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
J3KT08 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
J3KT08 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
J3KT08 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
J3KT08 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
J3KT08 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
J3KT08 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms