Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NEDD8-MDP1E9PL57 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NEDD8-MDP1E9PL57 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NEDD8-MDP1E9PL57 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NEDD8-MDP1E9PL57 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NEDD8-MDP1E9PL57 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
NEDD8-MDP1E9PL57 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NEDD8-MDP1E9PL57 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1E9PL57 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms