Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms