Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ11

PMS2P5, Postmeiotic segregation increased 2-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P5A8MQ11 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PMS2P5A8MQ11 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PMS2P5A8MQ11 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PMS2P5A8MQ11 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PMS2P5A8MQ11 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PMS2P5A8MQ11 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PMS2P5A8MQ11 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PMS2P5A8MQ11 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PMS2P5A8MQ11 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PMS2P5A8MQ11 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PMS2P5A8MQ11 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PMS2P5A8MQ11 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PMS2P5A8MQ11 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PMS2P5A8MQ11 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PMS2P5A8MQ11 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PMS2P5A8MQ11 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PMS2P5A8MQ11 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PMS2P5A8MQ11 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PMS2P5A8MQ11 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMS2P5A8MQ11 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PMS2P5A8MQ11 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMS2P5A8MQ11 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMS2P5A8MQ11 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMS2P5A8MQ11 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMS2P5A8MQ11 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMS2P5A8MQ11 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMS2P5A8MQ11 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMS2P5A8MQ11 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMS2P5A8MQ11 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMS2P5A8MQ11 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMS2P5A8MQ11 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMS2P5A8MQ11 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMS2P5A8MQ11 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMS2P5A8MQ11 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMS2P5A8MQ11 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMS2P5A8MQ11 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMS2P5A8MQ11 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMS2P5A8MQ11 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMS2P5A8MQ11 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PMS2P5A8MQ11 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMS2P5A8MQ11 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMS2P5A8MQ11 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMS2P5A8MQ11 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMS2P5A8MQ11 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMS2P5A8MQ11 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMS2P5A8MQ11 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMS2P5A8MQ11 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMS2P5A8MQ11 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMS2P5A8MQ11 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMS2P5A8MQ11 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMS2P5A8MQ11 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMS2P5A8MQ11 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMS2P5A8MQ11 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMS2P5A8MQ11 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMS2P5A8MQ11 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PMS2P5A8MQ11 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PMS2P5A8MQ11 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PMS2P5A8MQ11 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PMS2P5A8MQ11 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PMS2P5A8MQ11 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PMS2P5A8MQ11 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PMS2P5A8MQ11 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PMS2P5A8MQ11 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PMS2P5A8MQ11 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PMS2P5A8MQ11 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PMS2P5A8MQ11 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PMS2P5A8MQ11 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PMS2P5A8MQ11 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PMS2P5A8MQ11 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PMS2P5A8MQ11 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PMS2P5A8MQ11 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PMS2P5A8MQ11 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PMS2P5A8MQ11 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PMS2P5A8MQ11 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PMS2P5A8MQ11 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PMS2P5A8MQ11 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PMS2P5A8MQ11 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PMS2P5A8MQ11 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PMS2P5A8MQ11 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PMS2P5A8MQ11 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PMS2P5A8MQ11 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PMS2P5A8MQ11 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PMS2P5A8MQ11 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PMS2P5A8MQ11 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PMS2P5A8MQ11 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PMS2P5A8MQ11 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PMS2P5A8MQ11 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PMS2P5A8MQ11 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PMS2P5A8MQ11 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PMS2P5A8MQ11 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PMS2P5A8MQ11 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PMS2P5A8MQ11 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PMS2P5A8MQ11 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PMS2P5A8MQ11 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PMS2P5A8MQ11 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PMS2P5A8MQ11 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PMS2P5A8MQ11 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PMS2P5A8MQ11 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PMS2P5A8MQ11 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PMS2P5A8MQ11 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms