Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms