Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RGPD3A6NKT7 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
RGPD3A6NKT7 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RGPD3A6NKT7 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RGPD3A6NKT7 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RGPD3A6NKT7 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RGPD3A6NKT7 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
RGPD3A6NKT7 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RGPD3A6NKT7 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RGPD3A6NKT7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RGPD3A6NKT7 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RGPD3A6NKT7 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RGPD3A6NKT7 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RGPD3A6NKT7 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RGPD3A6NKT7 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RGPD3A6NKT7 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RGPD3A6NKT7 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RGPD3A6NKT7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RGPD3A6NKT7 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RGPD3A6NKT7 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
RGPD3A6NKT7 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RGPD3A6NKT7 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RGPD3A6NKT7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RGPD3A6NKT7 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RGPD3A6NKT7 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RGPD3A6NKT7 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RGPD3A6NKT7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RGPD3A6NKT7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RGPD3A6NKT7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RGPD3A6NKT7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RGPD3A6NKT7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RGPD3A6NKT7 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RGPD3A6NKT7 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RGPD3A6NKT7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RGPD3A6NKT7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RGPD3A6NKT7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RGPD3A6NKT7 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RGPD3A6NKT7 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RGPD3A6NKT7 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RGPD3A6NKT7 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RGPD3A6NKT7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RGPD3A6NKT7 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RGPD3A6NKT7 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
RGPD3A6NKT7 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RGPD3A6NKT7 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RGPD3A6NKT7 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RGPD3A6NKT7 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RGPD3A6NKT7 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RGPD3A6NKT7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RGPD3A6NKT7 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RGPD3A6NKT7 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RGPD3A6NKT7 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
RGPD3A6NKT7 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RGPD3A6NKT7 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
RGPD3A6NKT7 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
RGPD3A6NKT7 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RGPD3A6NKT7 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RGPD3A6NKT7 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RGPD3A6NKT7 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RGPD3A6NKT7 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RGPD3A6NKT7 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RGPD3A6NKT7 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RGPD3A6NKT7 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RGPD3A6NKT7 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RGPD3A6NKT7 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RGPD3A6NKT7 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
RGPD3A6NKT7 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RGPD3A6NKT7 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RGPD3A6NKT7 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
RGPD3A6NKT7 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RGPD3A6NKT7 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RGPD3A6NKT7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RGPD3A6NKT7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RGPD3A6NKT7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RGPD3A6NKT7 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RGPD3A6NKT7 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RGPD3A6NKT7 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RGPD3A6NKT7 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RGPD3A6NKT7 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
RGPD3A6NKT7 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RGPD3A6NKT7 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RGPD3A6NKT7 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RGPD3A6NKT7 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RGPD3A6NKT7 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
RGPD3A6NKT7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RGPD3A6NKT7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RGPD3A6NKT7 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RGPD3A6NKT7 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RGPD3A6NKT7 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RGPD3A6NKT7 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RGPD3A6NKT7 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RGPD3A6NKT7 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RGPD3A6NKT7 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RGPD3A6NKT7 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RGPD3A6NKT7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RGPD3A6NKT7 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RGPD3A6NKT7 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RGPD3A6NKT7 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RGPD3A6NKT7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RGPD3A6NKT7 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms