Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CFAP73A6NFT4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CFAP73A6NFT4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CFAP73A6NFT4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CFAP73A6NFT4 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CFAP73A6NFT4 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CFAP73A6NFT4 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CFAP73A6NFT4 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CFAP73A6NFT4 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CFAP73A6NFT4 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CFAP73A6NFT4 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CFAP73A6NFT4 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CFAP73A6NFT4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CFAP73A6NFT4 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CFAP73A6NFT4 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CFAP73A6NFT4 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CFAP73A6NFT4 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CFAP73A6NFT4 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CFAP73A6NFT4 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CFAP73A6NFT4 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CFAP73A6NFT4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CFAP73A6NFT4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CFAP73A6NFT4 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CFAP73A6NFT4 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CFAP73A6NFT4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CFAP73A6NFT4 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CFAP73A6NFT4 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CFAP73A6NFT4 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CFAP73A6NFT4 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CFAP73A6NFT4 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CFAP73A6NFT4 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CFAP73A6NFT4 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CFAP73A6NFT4 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CFAP73A6NFT4 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CFAP73A6NFT4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CFAP73A6NFT4 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CFAP73A6NFT4 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CFAP73A6NFT4 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CFAP73A6NFT4 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CFAP73A6NFT4 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CFAP73A6NFT4 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CFAP73A6NFT4 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CFAP73A6NFT4 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CFAP73A6NFT4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CFAP73A6NFT4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CFAP73A6NFT4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CFAP73A6NFT4 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CFAP73A6NFT4 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CFAP73A6NFT4 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CFAP73A6NFT4 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CFAP73A6NFT4 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CFAP73A6NFT4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CFAP73A6NFT4 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CFAP73A6NFT4 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CFAP73A6NFT4 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CFAP73A6NFT4 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CFAP73A6NFT4 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CFAP73A6NFT4 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CFAP73A6NFT4 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CFAP73A6NFT4 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CFAP73A6NFT4 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CFAP73A6NFT4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CFAP73A6NFT4 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CFAP73A6NFT4 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CFAP73A6NFT4 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CFAP73A6NFT4 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CFAP73A6NFT4 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CFAP73A6NFT4 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CFAP73A6NFT4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CFAP73A6NFT4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
CFAP73A6NFT4 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CFAP73A6NFT4 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CFAP73A6NFT4 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CFAP73A6NFT4 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CFAP73A6NFT4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CFAP73A6NFT4 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CFAP73A6NFT4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CFAP73A6NFT4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CFAP73A6NFT4 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CFAP73A6NFT4 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CFAP73A6NFT4 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CFAP73A6NFT4 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CFAP73A6NFT4 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CFAP73A6NFT4 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CFAP73A6NFT4 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CFAP73A6NFT4 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CFAP73A6NFT4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CFAP73A6NFT4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CFAP73A6NFT4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CFAP73A6NFT4 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CFAP73A6NFT4 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CFAP73A6NFT4 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CFAP73A6NFT4 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CFAP73A6NFT4 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CFAP73A6NFT4 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CFAP73A6NFT4 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CFAP73A6NFT4 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CFAP73A6NFT4 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CFAP73A6NFT4 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CFAP73A6NFT4 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms