Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WT02

TRAV9-2, T-cell receptor alpha variable 9-2 (Fragment), humanhuman

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Length 112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAV9-2A0A087WT02 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAV9-2A0A087WT02 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAV9-2A0A087WT02 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAV9-2A0A087WT02 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAV9-2A0A087WT02 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAV9-2A0A087WT02 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAV9-2A0A087WT02 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAV9-2A0A087WT02 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAV9-2A0A087WT02 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAV9-2A0A087WT02 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TRAV9-2A0A087WT02 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAV9-2A0A087WT02 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAV9-2A0A087WT02 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAV9-2A0A087WT02 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAV9-2A0A087WT02 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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TRAV9-2A0A087WT02 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAV9-2A0A087WT02 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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TRAV9-2A0A087WT02 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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