Protein–RNA interactions for Protein: P43088

PTGFR, Prostaglandin F2-alpha receptor, humanhuman

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGFRP43088 AC244102.1-201ENST00000437309 848 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 ASS1P11-201ENST00000441309 1216 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 LINC01738-201ENST00000454285 815 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 AL139383.1-201ENST00000454681 892 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 AC069213.3-201ENST00000454858 474 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 MNX1-204ENST00000469500 209 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 RN7SL659P-201ENST00000483093 299 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 PTPN20-215ENST00000505814 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 AC098679.2-201ENST00000513067 365 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 ZNF195-220ENST00000528796 881 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 ZNF123P-201ENST00000531501 1196 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 AP001372.1-202ENST00000533008 344 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 AC009248.1-201ENST00000548155 735 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 AC004477.2-201ENST00000583349 192 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 LINC01892-202ENST00000583985 540 ntTSL 4 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 AC004221.1-201ENST00000592843 844 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 OR7A3P-201ENST00000595284 907 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 AC063977.1-201ENST00000600623 371 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 AC002470.1-201ENST00000610278 395 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 Metazoa_SRP.45-201ENST00000620896 299 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 AC005786.4-201ENST00000623369 682 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 AC011472.5-201ENST00000624079 508 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 AC005086.2-201ENST00000624939 228 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 RANBP2-205ENST00000629728 156 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 FAM238A-202ENST00000637359 442 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 AL359551.1-201ENST00000442726 2900 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 ANKFY1-201ENST00000341657 7418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 AC139256.1-201ENST00000569858 2598 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 RN7SKP23-201ENST00000625159 4301 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 PTGS2-201ENST00000367468 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 TRAPPC2-203ENST00000380579 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 AC092894.1-201ENST00000486726 1563 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 ZNF43-201ENST00000354959 2881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 AL035555.1-201ENST00000404462 1790 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 ARMC3-202ENST00000376528 3258 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 LINC02102-201ENST00000503989 3364 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 ZNF812P-202ENST00000536819 1890 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 HIST1H2BN-203ENST00000606613 4137 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 ELK3-201ENST00000228741 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 NRXN3-203ENST00000428277 4219 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 EFCAB1-201ENST00000262103 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 ADAM20P1-202ENST00000556964 3034 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 BTF3L4-202ENST00000472944 2159 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 AC120114.2-201ENST00000567795 2272 ntBASIC7.27□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 CCR6-203ENST00000400926 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 LINC01588-202ENST00000528300 3208 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 LIMS1-203ENST00000393310 4392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 HPS5-201ENST00000349215 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 PTPRG-AS1-204ENST00000474795 2661 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 KCNIP4-204ENST00000382150 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 AC060780.1-202ENST00000590740 5084 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 RBFOX2-207ENST00000414461 1706 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 MAML2-202ENST00000618849 3154 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 SLC7A14-201ENST00000231706 10103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 CD46-205ENST00000358170 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
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PTGFRP43088 VPS41-202ENST00000310301 5903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 SLC23A2-201ENST00000338244 6944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
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PTGFRP43088 C2orf76-203ENST00000409523 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 Z68871.1-201ENST00000426528 1133 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
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PTGFRP43088 ENPP7P1-201ENST00000509557 999 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 LINC02222-201ENST00000513535 1039 ntTSL 4 BASIC7.27□□□□□ -1.25
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PTGFRP43088 OR7E159P-201ENST00000553761 298 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 AC012414.3-201ENST00000559621 748 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 LINC01572-202ENST00000563770 568 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 LINC02191-201ENST00000568036 518 ntTSL 4 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 AP005202.3-201ENST00000582033 567 ntTSL 4 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 AC005838.2-201ENST00000584643 317 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 AC008649.2-201ENST00000585999 242 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 AC026458.2-201ENST00000589323 531 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 C1orf186-209ENST00000603488 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 GPC6-202ENST00000617456 792 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 RFPL3-AS1_1.1-201ENST00000617561 88 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 ARL17A-206ENST00000622488 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 AC024580.1-201ENST00000623020 674 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 AC010894.5-201ENST00000624428 951 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 LINC01320-209ENST00000625995 928 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 UQCRC2-213ENST00000630839 535 ntTSL 4 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 AL133464.1-204ENST00000634280 1094 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 VNN3-212ENST00000519686 1377 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PTGFRP43088 AP002759.1-201ENST00000526840 1571 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
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