Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 FAM20A-207ENST00000619787 2798 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 OR2T10-202ENST00000642090 3519 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 MIR3976HG-202ENST00000566533 1690 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 ZNF512-203ENST00000413371 3703 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 TACC2-207ENST00000369000 3813 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 NUMA1-232ENST00000613205 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 AC016722.2-201ENST00000429761 1835 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 AC145207.5-201ENST00000582866 2682 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 USP13-203ENST00000496897 2747 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 RBPJ-201ENST00000342295 5860 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 ATP5O-201ENST00000290299 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 RNU1-7P-201ENST00000364105 164 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 SNORA58.1-201ENST00000364133 136 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 RNA5SP141-201ENST00000364543 120 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 AC005005.1-201ENST00000397595 682 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 RPL31-202ENST00000409000 641 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 HMGN1P34-201ENST00000413023 290 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 SEM1-203ENST00000413065 661 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 RFFL-203ENST00000413582 1217 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 AC010967.1-201ENST00000421575 489 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 RNF212B-203ENST00000430154 903 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 RPP21-223ENST00000436442 522 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 WBP1LP7-201ENST00000437905 363 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 AL512637.1-201ENST00000439523 1231 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 AC011193.1-202ENST00000441287 323 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 MTND6P21-201ENST00000443620 482 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 AL445673.1-201ENST00000455124 416 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 CENPS-202ENST00000462462 584 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 CASQ1-202ENST00000467691 595 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 AC002384.1-202ENST00000470135 673 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 AL645949.1-201ENST00000510094 324 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 AC022092.1-201ENST00000510230 504 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 TECRP1-201ENST00000513307 445 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 IGHVIII-51-1-201ENST00000519403 302 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 AC087379.2-201ENST00000532242 471 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 AC120045.1-202ENST00000567770 1068 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 MIR4440-201ENST00000583986 98 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 TEX26-AS1-215ENST00000591300 815 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 AC005954.1-201ENST00000591962 337 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 AL109930.1-201ENST00000606932 724 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 AC026367.2-201ENST00000610630 553 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 AC009237.16-201ENST00000612987 506 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 AC015574.1-201ENST00000615194 489 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 GLTP-206ENST00000617457 969 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 HIST1H4L-201ENST00000618305 312 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 AC006213.5-201ENST00000619673 288 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 MIR3150A-201ENST00000636546 80 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 TMEM182-211ENST00000640575 1155 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 STXBP5L-205ENST00000472879 3067 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 MPZL3-201ENST00000278949 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 LINC00343-202ENST00000415294 1320 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 ABLIM1-205ENST00000369266 2230 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 CEACAM5-210ENST00000617332 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 SERPINB9-201ENST00000380698 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 GLULP5-201ENST00000547831 1390 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 GABRQ-201ENST00000598523 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 IRAK4-214ENST00000613694 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 MMP13-202ENST00000340273 1470 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 ATP6V1C1-203ENST00000518857 1501 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 RNPC3-208ENST00000533099 3641 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 GC-208ENST00000513476 1567 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 LRRC37A9P-201ENST00000603850 5376 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 GOSR2-240ENST00000640621 3059 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 TRIT1-203ENST00000441669 1851 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 GSTCD-201ENST00000360505 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 PLCG2-201ENST00000359376 3819 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 ELK3-201ENST00000228741 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 TRIM55-204ENST00000353317 2624 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 KIF4B-201ENST00000435029 4378 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 ZNF615-208ENST00000598071 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 PTGS2-201ENST00000367468 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 PIWIL3-202ENST00000527701 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 APEX2-201ENST00000374987 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 HNRNPA1P54-201ENST00000411857 9714 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 CACNB2-201ENST00000282343 3524 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 LYG1-201ENST00000308528 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 AP000769.1-204ENST00000309775 800 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 OR1J2-201ENST00000335302 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 SNORD3G-201ENST00000362796 215 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 EGFLAM-205ENST00000397210 1299 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 ZNF736P10Y-201ENST00000403990 1110 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 ZFY-AS1-201ENST00000417305 500 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 AL121999.1-201ENST00000420156 332 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 TRMT112P4-201ENST00000429016 379 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 RPS29P3-201ENST00000439929 171 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 AC087499.3-202ENST00000441215 1173 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 PSPC1P1-201ENST00000442352 665 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 AC073188.1-201ENST00000442493 361 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 TARDBPP2-201ENST00000448913 1231 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 AC006455.3-201ENST00000454641 333 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 DCD-202ENST00000456047 670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 RN7SL291P-201ENST00000487916 289 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 PAX8-211ENST00000497038 816 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 AC112173.1-201ENST00000505876 327 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 AC116345.1-202ENST00000513379 941 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 IGLC5-201ENST00000519670 293 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 PRR13P2-201ENST00000533804 406 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 AC113143.1-201ENST00000534670 301 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 PCED1B-AS1-205ENST00000548222 625 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
TMEM225BP0DP42 AP4S1-206ENST00000554609 1012 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.8 ms