Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q8

GTF3C5, General transcription factor 3C polypeptide 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 519 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C5Q9Y5Q8 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF3C5Q9Y5Q8 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF3C5Q9Y5Q8 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF3C5Q9Y5Q8 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF3C5Q9Y5Q8 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF3C5Q9Y5Q8 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF3C5Q9Y5Q8 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF3C5Q9Y5Q8 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF3C5Q9Y5Q8 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF3C5Q9Y5Q8 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF3C5Q9Y5Q8 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF3C5Q9Y5Q8 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF3C5Q9Y5Q8 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF3C5Q9Y5Q8 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF3C5Q9Y5Q8 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF3C5Q9Y5Q8 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF3C5Q9Y5Q8 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF3C5Q9Y5Q8 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF3C5Q9Y5Q8 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF3C5Q9Y5Q8 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF3C5Q9Y5Q8 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF3C5Q9Y5Q8 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF3C5Q9Y5Q8 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF3C5Q9Y5Q8 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF3C5Q9Y5Q8 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF3C5Q9Y5Q8 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF3C5Q9Y5Q8 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF3C5Q9Y5Q8 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF3C5Q9Y5Q8 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF3C5Q9Y5Q8 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF3C5Q9Y5Q8 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF3C5Q9Y5Q8 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF3C5Q9Y5Q8 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF3C5Q9Y5Q8 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF3C5Q9Y5Q8 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF3C5Q9Y5Q8 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF3C5Q9Y5Q8 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF3C5Q9Y5Q8 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF3C5Q9Y5Q8 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF3C5Q9Y5Q8 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF3C5Q9Y5Q8 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF3C5Q9Y5Q8 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF3C5Q9Y5Q8 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF3C5Q9Y5Q8 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF3C5Q9Y5Q8 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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GTF3C5Q9Y5Q8 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF3C5Q9Y5Q8 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF3C5Q9Y5Q8 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF3C5Q9Y5Q8 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF3C5Q9Y5Q8 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
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GTF3C5Q9Y5Q8 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
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GTF3C5Q9Y5Q8 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF3C5Q9Y5Q8 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF3C5Q9Y5Q8 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF3C5Q9Y5Q8 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF3C5Q9Y5Q8 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF3C5Q9Y5Q8 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF3C5Q9Y5Q8 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF3C5Q9Y5Q8 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF3C5Q9Y5Q8 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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GTF3C5Q9Y5Q8 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF3C5Q9Y5Q8 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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GTF3C5Q9Y5Q8 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF3C5Q9Y5Q8 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF3C5Q9Y5Q8 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF3C5Q9Y5Q8 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF3C5Q9Y5Q8 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF3C5Q9Y5Q8 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF3C5Q9Y5Q8 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF3C5Q9Y5Q8 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF3C5Q9Y5Q8 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF3C5Q9Y5Q8 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF3C5Q9Y5Q8 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF3C5Q9Y5Q8 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF3C5Q9Y5Q8 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF3C5Q9Y5Q8 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF3C5Q9Y5Q8 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF3C5Q9Y5Q8 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF3C5Q9Y5Q8 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF3C5Q9Y5Q8 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF3C5Q9Y5Q8 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF3C5Q9Y5Q8 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF3C5Q9Y5Q8 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GTF3C5Q9Y5Q8 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GTF3C5Q9Y5Q8 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GTF3C5Q9Y5Q8 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GTF3C5Q9Y5Q8 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF3C5Q9Y5Q8 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF3C5Q9Y5Q8 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF3C5Q9Y5Q8 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF3C5Q9Y5Q8 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF3C5Q9Y5Q8 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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