Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4W6

AFG3L2, AFG3-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L2Q9Y4W6 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AFG3L2Q9Y4W6 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AFG3L2Q9Y4W6 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AFG3L2Q9Y4W6 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AFG3L2Q9Y4W6 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AFG3L2Q9Y4W6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AFG3L2Q9Y4W6 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AFG3L2Q9Y4W6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AFG3L2Q9Y4W6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AFG3L2Q9Y4W6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AFG3L2Q9Y4W6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AFG3L2Q9Y4W6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
AFG3L2Q9Y4W6 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
AFG3L2Q9Y4W6 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AFG3L2Q9Y4W6 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
AFG3L2Q9Y4W6 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
AFG3L2Q9Y4W6 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
AFG3L2Q9Y4W6 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
AFG3L2Q9Y4W6 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
AFG3L2Q9Y4W6 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
AFG3L2Q9Y4W6 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
AFG3L2Q9Y4W6 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
AFG3L2Q9Y4W6 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
AFG3L2Q9Y4W6 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AFG3L2Q9Y4W6 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AFG3L2Q9Y4W6 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AFG3L2Q9Y4W6 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AFG3L2Q9Y4W6 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AFG3L2Q9Y4W6 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AFG3L2Q9Y4W6 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AFG3L2Q9Y4W6 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AFG3L2Q9Y4W6 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AFG3L2Q9Y4W6 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AFG3L2Q9Y4W6 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AFG3L2Q9Y4W6 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
AFG3L2Q9Y4W6 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AFG3L2Q9Y4W6 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AFG3L2Q9Y4W6 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AFG3L2Q9Y4W6 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AFG3L2Q9Y4W6 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AFG3L2Q9Y4W6 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
AFG3L2Q9Y4W6 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AFG3L2Q9Y4W6 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AFG3L2Q9Y4W6 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AFG3L2Q9Y4W6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AFG3L2Q9Y4W6 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AFG3L2Q9Y4W6 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
AFG3L2Q9Y4W6 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AFG3L2Q9Y4W6 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
AFG3L2Q9Y4W6 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
AFG3L2Q9Y4W6 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
AFG3L2Q9Y4W6 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AFG3L2Q9Y4W6 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
AFG3L2Q9Y4W6 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AFG3L2Q9Y4W6 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
AFG3L2Q9Y4W6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AFG3L2Q9Y4W6 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AFG3L2Q9Y4W6 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AFG3L2Q9Y4W6 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AFG3L2Q9Y4W6 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AFG3L2Q9Y4W6 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AFG3L2Q9Y4W6 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AFG3L2Q9Y4W6 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AFG3L2Q9Y4W6 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AFG3L2Q9Y4W6 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AFG3L2Q9Y4W6 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AFG3L2Q9Y4W6 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
AFG3L2Q9Y4W6 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AFG3L2Q9Y4W6 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AFG3L2Q9Y4W6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AFG3L2Q9Y4W6 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AFG3L2Q9Y4W6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
AFG3L2Q9Y4W6 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
AFG3L2Q9Y4W6 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
AFG3L2Q9Y4W6 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
AFG3L2Q9Y4W6 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
AFG3L2Q9Y4W6 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AFG3L2Q9Y4W6 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AFG3L2Q9Y4W6 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AFG3L2Q9Y4W6 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
AFG3L2Q9Y4W6 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
AFG3L2Q9Y4W6 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
AFG3L2Q9Y4W6 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
AFG3L2Q9Y4W6 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
AFG3L2Q9Y4W6 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
AFG3L2Q9Y4W6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
AFG3L2Q9Y4W6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AFG3L2Q9Y4W6 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AFG3L2Q9Y4W6 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
AFG3L2Q9Y4W6 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
AFG3L2Q9Y4W6 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
AFG3L2Q9Y4W6 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AFG3L2Q9Y4W6 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
AFG3L2Q9Y4W6 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AFG3L2Q9Y4W6 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
AFG3L2Q9Y4W6 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AFG3L2Q9Y4W6 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
AFG3L2Q9Y4W6 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
AFG3L2Q9Y4W6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AFG3L2Q9Y4W6 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms