Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4A8

NFE2L3, Nuclear factor erythroid 2-related factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2L3Q9Y4A8 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NFE2L3Q9Y4A8 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NFE2L3Q9Y4A8 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NFE2L3Q9Y4A8 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NFE2L3Q9Y4A8 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NFE2L3Q9Y4A8 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NFE2L3Q9Y4A8 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NFE2L3Q9Y4A8 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NFE2L3Q9Y4A8 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NFE2L3Q9Y4A8 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NFE2L3Q9Y4A8 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NFE2L3Q9Y4A8 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NFE2L3Q9Y4A8 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NFE2L3Q9Y4A8 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NFE2L3Q9Y4A8 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NFE2L3Q9Y4A8 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NFE2L3Q9Y4A8 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NFE2L3Q9Y4A8 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NFE2L3Q9Y4A8 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NFE2L3Q9Y4A8 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NFE2L3Q9Y4A8 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NFE2L3Q9Y4A8 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NFE2L3Q9Y4A8 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NFE2L3Q9Y4A8 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NFE2L3Q9Y4A8 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NFE2L3Q9Y4A8 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NFE2L3Q9Y4A8 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NFE2L3Q9Y4A8 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NFE2L3Q9Y4A8 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NFE2L3Q9Y4A8 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NFE2L3Q9Y4A8 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NFE2L3Q9Y4A8 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NFE2L3Q9Y4A8 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NFE2L3Q9Y4A8 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NFE2L3Q9Y4A8 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NFE2L3Q9Y4A8 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NFE2L3Q9Y4A8 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NFE2L3Q9Y4A8 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NFE2L3Q9Y4A8 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NFE2L3Q9Y4A8 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NFE2L3Q9Y4A8 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NFE2L3Q9Y4A8 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NFE2L3Q9Y4A8 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NFE2L3Q9Y4A8 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NFE2L3Q9Y4A8 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NFE2L3Q9Y4A8 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NFE2L3Q9Y4A8 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NFE2L3Q9Y4A8 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NFE2L3Q9Y4A8 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NFE2L3Q9Y4A8 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NFE2L3Q9Y4A8 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NFE2L3Q9Y4A8 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NFE2L3Q9Y4A8 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NFE2L3Q9Y4A8 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NFE2L3Q9Y4A8 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NFE2L3Q9Y4A8 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NFE2L3Q9Y4A8 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NFE2L3Q9Y4A8 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NFE2L3Q9Y4A8 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NFE2L3Q9Y4A8 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NFE2L3Q9Y4A8 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NFE2L3Q9Y4A8 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NFE2L3Q9Y4A8 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NFE2L3Q9Y4A8 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NFE2L3Q9Y4A8 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NFE2L3Q9Y4A8 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NFE2L3Q9Y4A8 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFE2L3Q9Y4A8 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFE2L3Q9Y4A8 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFE2L3Q9Y4A8 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFE2L3Q9Y4A8 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFE2L3Q9Y4A8 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFE2L3Q9Y4A8 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFE2L3Q9Y4A8 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFE2L3Q9Y4A8 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFE2L3Q9Y4A8 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFE2L3Q9Y4A8 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFE2L3Q9Y4A8 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFE2L3Q9Y4A8 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFE2L3Q9Y4A8 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFE2L3Q9Y4A8 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFE2L3Q9Y4A8 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFE2L3Q9Y4A8 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFE2L3Q9Y4A8 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFE2L3Q9Y4A8 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFE2L3Q9Y4A8 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFE2L3Q9Y4A8 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFE2L3Q9Y4A8 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFE2L3Q9Y4A8 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NFE2L3Q9Y4A8 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NFE2L3Q9Y4A8 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NFE2L3Q9Y4A8 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NFE2L3Q9Y4A8 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NFE2L3Q9Y4A8 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NFE2L3Q9Y4A8 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NFE2L3Q9Y4A8 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NFE2L3Q9Y4A8 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NFE2L3Q9Y4A8 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NFE2L3Q9Y4A8 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NFE2L3Q9Y4A8 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
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