Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Y2

CHTOP, Chromatin target of PRMT1 protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTOPQ9Y3Y2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHTOPQ9Y3Y2 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms