Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms