Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I6

NINL, Ninein-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NINLQ9Y2I6 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NINLQ9Y2I6 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NINLQ9Y2I6 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NINLQ9Y2I6 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NINLQ9Y2I6 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NINLQ9Y2I6 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NINLQ9Y2I6 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NINLQ9Y2I6 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NINLQ9Y2I6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NINLQ9Y2I6 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NINLQ9Y2I6 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
NINLQ9Y2I6 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NINLQ9Y2I6 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NINLQ9Y2I6 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NINLQ9Y2I6 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NINLQ9Y2I6 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NINLQ9Y2I6 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NINLQ9Y2I6 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NINLQ9Y2I6 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NINLQ9Y2I6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NINLQ9Y2I6 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NINLQ9Y2I6 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NINLQ9Y2I6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NINLQ9Y2I6 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NINLQ9Y2I6 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NINLQ9Y2I6 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
NINLQ9Y2I6 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NINLQ9Y2I6 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NINLQ9Y2I6 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NINLQ9Y2I6 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NINLQ9Y2I6 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NINLQ9Y2I6 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NINLQ9Y2I6 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NINLQ9Y2I6 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NINLQ9Y2I6 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NINLQ9Y2I6 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NINLQ9Y2I6 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NINLQ9Y2I6 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
NINLQ9Y2I6 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NINLQ9Y2I6 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
NINLQ9Y2I6 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NINLQ9Y2I6 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NINLQ9Y2I6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NINLQ9Y2I6 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NINLQ9Y2I6 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NINLQ9Y2I6 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NINLQ9Y2I6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NINLQ9Y2I6 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NINLQ9Y2I6 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NINLQ9Y2I6 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NINLQ9Y2I6 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NINLQ9Y2I6 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
NINLQ9Y2I6 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NINLQ9Y2I6 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NINLQ9Y2I6 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NINLQ9Y2I6 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NINLQ9Y2I6 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NINLQ9Y2I6 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NINLQ9Y2I6 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NINLQ9Y2I6 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
NINLQ9Y2I6 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NINLQ9Y2I6 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
NINLQ9Y2I6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NINLQ9Y2I6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NINLQ9Y2I6 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NINLQ9Y2I6 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NINLQ9Y2I6 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NINLQ9Y2I6 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NINLQ9Y2I6 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NINLQ9Y2I6 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NINLQ9Y2I6 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NINLQ9Y2I6 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NINLQ9Y2I6 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NINLQ9Y2I6 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NINLQ9Y2I6 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NINLQ9Y2I6 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
NINLQ9Y2I6 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NINLQ9Y2I6 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NINLQ9Y2I6 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NINLQ9Y2I6 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NINLQ9Y2I6 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NINLQ9Y2I6 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NINLQ9Y2I6 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NINLQ9Y2I6 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NINLQ9Y2I6 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NINLQ9Y2I6 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NINLQ9Y2I6 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NINLQ9Y2I6 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
NINLQ9Y2I6 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NINLQ9Y2I6 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NINLQ9Y2I6 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NINLQ9Y2I6 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NINLQ9Y2I6 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NINLQ9Y2I6 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NINLQ9Y2I6 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NINLQ9Y2I6 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NINLQ9Y2I6 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NINLQ9Y2I6 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NINLQ9Y2I6 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NINLQ9Y2I6 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms