Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G9

SBNO2, Protein strawberry notch homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO2Q9Y2G9 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SBNO2Q9Y2G9 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SBNO2Q9Y2G9 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SBNO2Q9Y2G9 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
SBNO2Q9Y2G9 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SBNO2Q9Y2G9 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SBNO2Q9Y2G9 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
SBNO2Q9Y2G9 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SBNO2Q9Y2G9 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SBNO2Q9Y2G9 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SBNO2Q9Y2G9 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SBNO2Q9Y2G9 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SBNO2Q9Y2G9 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SBNO2Q9Y2G9 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SBNO2Q9Y2G9 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SBNO2Q9Y2G9 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SBNO2Q9Y2G9 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SBNO2Q9Y2G9 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SBNO2Q9Y2G9 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SBNO2Q9Y2G9 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SBNO2Q9Y2G9 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SBNO2Q9Y2G9 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SBNO2Q9Y2G9 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SBNO2Q9Y2G9 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SBNO2Q9Y2G9 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SBNO2Q9Y2G9 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SBNO2Q9Y2G9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SBNO2Q9Y2G9 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SBNO2Q9Y2G9 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SBNO2Q9Y2G9 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SBNO2Q9Y2G9 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SBNO2Q9Y2G9 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SBNO2Q9Y2G9 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SBNO2Q9Y2G9 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SBNO2Q9Y2G9 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SBNO2Q9Y2G9 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SBNO2Q9Y2G9 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SBNO2Q9Y2G9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SBNO2Q9Y2G9 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SBNO2Q9Y2G9 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SBNO2Q9Y2G9 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SBNO2Q9Y2G9 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SBNO2Q9Y2G9 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SBNO2Q9Y2G9 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SBNO2Q9Y2G9 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SBNO2Q9Y2G9 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SBNO2Q9Y2G9 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SBNO2Q9Y2G9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SBNO2Q9Y2G9 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SBNO2Q9Y2G9 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SBNO2Q9Y2G9 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SBNO2Q9Y2G9 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SBNO2Q9Y2G9 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
SBNO2Q9Y2G9 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SBNO2Q9Y2G9 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SBNO2Q9Y2G9 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SBNO2Q9Y2G9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SBNO2Q9Y2G9 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SBNO2Q9Y2G9 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SBNO2Q9Y2G9 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SBNO2Q9Y2G9 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SBNO2Q9Y2G9 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SBNO2Q9Y2G9 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SBNO2Q9Y2G9 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SBNO2Q9Y2G9 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
SBNO2Q9Y2G9 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SBNO2Q9Y2G9 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SBNO2Q9Y2G9 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SBNO2Q9Y2G9 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SBNO2Q9Y2G9 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SBNO2Q9Y2G9 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SBNO2Q9Y2G9 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SBNO2Q9Y2G9 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SBNO2Q9Y2G9 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SBNO2Q9Y2G9 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SBNO2Q9Y2G9 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SBNO2Q9Y2G9 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SBNO2Q9Y2G9 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SBNO2Q9Y2G9 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SBNO2Q9Y2G9 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SBNO2Q9Y2G9 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SBNO2Q9Y2G9 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SBNO2Q9Y2G9 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SBNO2Q9Y2G9 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SBNO2Q9Y2G9 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SBNO2Q9Y2G9 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SBNO2Q9Y2G9 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SBNO2Q9Y2G9 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SBNO2Q9Y2G9 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SBNO2Q9Y2G9 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SBNO2Q9Y2G9 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SBNO2Q9Y2G9 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SBNO2Q9Y2G9 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SBNO2Q9Y2G9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SBNO2Q9Y2G9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SBNO2Q9Y2G9 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SBNO2Q9Y2G9 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SBNO2Q9Y2G9 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SBNO2Q9Y2G9 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SBNO2Q9Y2G9 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms