Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y282

ERGIC3, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERGIC3Q9Y282 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERGIC3Q9Y282 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERGIC3Q9Y282 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERGIC3Q9Y282 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERGIC3Q9Y282 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERGIC3Q9Y282 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERGIC3Q9Y282 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERGIC3Q9Y282 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERGIC3Q9Y282 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERGIC3Q9Y282 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERGIC3Q9Y282 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERGIC3Q9Y282 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERGIC3Q9Y282 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERGIC3Q9Y282 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERGIC3Q9Y282 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERGIC3Q9Y282 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERGIC3Q9Y282 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERGIC3Q9Y282 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERGIC3Q9Y282 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERGIC3Q9Y282 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERGIC3Q9Y282 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERGIC3Q9Y282 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERGIC3Q9Y282 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERGIC3Q9Y282 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERGIC3Q9Y282 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERGIC3Q9Y282 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERGIC3Q9Y282 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERGIC3Q9Y282 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERGIC3Q9Y282 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERGIC3Q9Y282 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERGIC3Q9Y282 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERGIC3Q9Y282 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERGIC3Q9Y282 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERGIC3Q9Y282 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERGIC3Q9Y282 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERGIC3Q9Y282 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERGIC3Q9Y282 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERGIC3Q9Y282 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERGIC3Q9Y282 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERGIC3Q9Y282 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERGIC3Q9Y282 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ERGIC3Q9Y282 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ERGIC3Q9Y282 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ERGIC3Q9Y282 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ERGIC3Q9Y282 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERGIC3Q9Y282 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERGIC3Q9Y282 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERGIC3Q9Y282 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERGIC3Q9Y282 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERGIC3Q9Y282 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERGIC3Q9Y282 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERGIC3Q9Y282 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERGIC3Q9Y282 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERGIC3Q9Y282 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERGIC3Q9Y282 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERGIC3Q9Y282 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ERGIC3Q9Y282 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERGIC3Q9Y282 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERGIC3Q9Y282 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERGIC3Q9Y282 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERGIC3Q9Y282 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERGIC3Q9Y282 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERGIC3Q9Y282 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERGIC3Q9Y282 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERGIC3Q9Y282 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERGIC3Q9Y282 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERGIC3Q9Y282 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERGIC3Q9Y282 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERGIC3Q9Y282 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERGIC3Q9Y282 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERGIC3Q9Y282 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERGIC3Q9Y282 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERGIC3Q9Y282 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERGIC3Q9Y282 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERGIC3Q9Y282 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERGIC3Q9Y282 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERGIC3Q9Y282 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERGIC3Q9Y282 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERGIC3Q9Y282 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERGIC3Q9Y282 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERGIC3Q9Y282 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERGIC3Q9Y282 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ERGIC3Q9Y282 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERGIC3Q9Y282 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERGIC3Q9Y282 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERGIC3Q9Y282 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERGIC3Q9Y282 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERGIC3Q9Y282 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERGIC3Q9Y282 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERGIC3Q9Y282 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERGIC3Q9Y282 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERGIC3Q9Y282 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERGIC3Q9Y282 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERGIC3Q9Y282 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERGIC3Q9Y282 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERGIC3Q9Y282 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERGIC3Q9Y282 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERGIC3Q9Y282 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERGIC3Q9Y282 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERGIC3Q9Y282 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms