Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM35Q9UPQ4 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM35Q9UPQ4 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIM35Q9UPQ4 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIM35Q9UPQ4 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIM35Q9UPQ4 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIM35Q9UPQ4 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIM35Q9UPQ4 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIM35Q9UPQ4 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIM35Q9UPQ4 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIM35Q9UPQ4 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIM35Q9UPQ4 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIM35Q9UPQ4 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIM35Q9UPQ4 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIM35Q9UPQ4 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIM35Q9UPQ4 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM35Q9UPQ4 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM35Q9UPQ4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM35Q9UPQ4 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM35Q9UPQ4 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM35Q9UPQ4 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM35Q9UPQ4 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM35Q9UPQ4 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM35Q9UPQ4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM35Q9UPQ4 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM35Q9UPQ4 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM35Q9UPQ4 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM35Q9UPQ4 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM35Q9UPQ4 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM35Q9UPQ4 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM35Q9UPQ4 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM35Q9UPQ4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM35Q9UPQ4 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM35Q9UPQ4 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM35Q9UPQ4 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM35Q9UPQ4 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM35Q9UPQ4 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM35Q9UPQ4 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM35Q9UPQ4 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM35Q9UPQ4 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM35Q9UPQ4 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM35Q9UPQ4 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM35Q9UPQ4 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRIM35Q9UPQ4 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRIM35Q9UPQ4 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRIM35Q9UPQ4 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRIM35Q9UPQ4 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRIM35Q9UPQ4 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRIM35Q9UPQ4 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRIM35Q9UPQ4 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRIM35Q9UPQ4 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRIM35Q9UPQ4 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRIM35Q9UPQ4 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRIM35Q9UPQ4 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRIM35Q9UPQ4 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRIM35Q9UPQ4 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRIM35Q9UPQ4 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRIM35Q9UPQ4 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRIM35Q9UPQ4 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRIM35Q9UPQ4 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRIM35Q9UPQ4 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRIM35Q9UPQ4 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRIM35Q9UPQ4 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRIM35Q9UPQ4 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRIM35Q9UPQ4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRIM35Q9UPQ4 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRIM35Q9UPQ4 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
TRIM35Q9UPQ4 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRIM35Q9UPQ4 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRIM35Q9UPQ4 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRIM35Q9UPQ4 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRIM35Q9UPQ4 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRIM35Q9UPQ4 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRIM35Q9UPQ4 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRIM35Q9UPQ4 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRIM35Q9UPQ4 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRIM35Q9UPQ4 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRIM35Q9UPQ4 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRIM35Q9UPQ4 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRIM35Q9UPQ4 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRIM35Q9UPQ4 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRIM35Q9UPQ4 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRIM35Q9UPQ4 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRIM35Q9UPQ4 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRIM35Q9UPQ4 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRIM35Q9UPQ4 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
TRIM35Q9UPQ4 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRIM35Q9UPQ4 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM35Q9UPQ4 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM35Q9UPQ4 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM35Q9UPQ4 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM35Q9UPQ4 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM35Q9UPQ4 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM35Q9UPQ4 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM35Q9UPQ4 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM35Q9UPQ4 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM35Q9UPQ4 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM35Q9UPQ4 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM35Q9UPQ4 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM35Q9UPQ4 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms