Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPN6

SCAF8, Protein SCAF8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF8Q9UPN6 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCAF8Q9UPN6 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCAF8Q9UPN6 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCAF8Q9UPN6 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCAF8Q9UPN6 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCAF8Q9UPN6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCAF8Q9UPN6 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCAF8Q9UPN6 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCAF8Q9UPN6 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCAF8Q9UPN6 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCAF8Q9UPN6 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCAF8Q9UPN6 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCAF8Q9UPN6 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCAF8Q9UPN6 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCAF8Q9UPN6 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SCAF8Q9UPN6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCAF8Q9UPN6 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCAF8Q9UPN6 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCAF8Q9UPN6 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCAF8Q9UPN6 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCAF8Q9UPN6 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCAF8Q9UPN6 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCAF8Q9UPN6 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCAF8Q9UPN6 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCAF8Q9UPN6 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCAF8Q9UPN6 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCAF8Q9UPN6 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCAF8Q9UPN6 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCAF8Q9UPN6 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCAF8Q9UPN6 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCAF8Q9UPN6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCAF8Q9UPN6 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCAF8Q9UPN6 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCAF8Q9UPN6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCAF8Q9UPN6 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCAF8Q9UPN6 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCAF8Q9UPN6 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCAF8Q9UPN6 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCAF8Q9UPN6 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SCAF8Q9UPN6 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCAF8Q9UPN6 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCAF8Q9UPN6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCAF8Q9UPN6 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCAF8Q9UPN6 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCAF8Q9UPN6 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCAF8Q9UPN6 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCAF8Q9UPN6 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCAF8Q9UPN6 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SCAF8Q9UPN6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCAF8Q9UPN6 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCAF8Q9UPN6 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SCAF8Q9UPN6 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SCAF8Q9UPN6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCAF8Q9UPN6 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCAF8Q9UPN6 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCAF8Q9UPN6 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCAF8Q9UPN6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCAF8Q9UPN6 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCAF8Q9UPN6 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCAF8Q9UPN6 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCAF8Q9UPN6 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SCAF8Q9UPN6 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCAF8Q9UPN6 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCAF8Q9UPN6 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SCAF8Q9UPN6 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCAF8Q9UPN6 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCAF8Q9UPN6 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCAF8Q9UPN6 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCAF8Q9UPN6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCAF8Q9UPN6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCAF8Q9UPN6 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCAF8Q9UPN6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCAF8Q9UPN6 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCAF8Q9UPN6 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCAF8Q9UPN6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCAF8Q9UPN6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCAF8Q9UPN6 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCAF8Q9UPN6 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCAF8Q9UPN6 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCAF8Q9UPN6 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCAF8Q9UPN6 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCAF8Q9UPN6 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCAF8Q9UPN6 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SCAF8Q9UPN6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCAF8Q9UPN6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCAF8Q9UPN6 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCAF8Q9UPN6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCAF8Q9UPN6 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCAF8Q9UPN6 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCAF8Q9UPN6 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCAF8Q9UPN6 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCAF8Q9UPN6 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCAF8Q9UPN6 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCAF8Q9UPN6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCAF8Q9UPN6 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SCAF8Q9UPN6 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCAF8Q9UPN6 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SCAF8Q9UPN6 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCAF8Q9UPN6 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCAF8Q9UPN6 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms