Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTF2Q9UNY4 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTF2Q9UNY4 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTF2Q9UNY4 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTF2Q9UNY4 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTF2Q9UNY4 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTF2Q9UNY4 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTF2Q9UNY4 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTF2Q9UNY4 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTF2Q9UNY4 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTF2Q9UNY4 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTF2Q9UNY4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTF2Q9UNY4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTF2Q9UNY4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTF2Q9UNY4 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTF2Q9UNY4 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTF2Q9UNY4 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTF2Q9UNY4 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTF2Q9UNY4 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTF2Q9UNY4 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTF2Q9UNY4 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTF2Q9UNY4 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTF2Q9UNY4 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TTF2Q9UNY4 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTF2Q9UNY4 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTF2Q9UNY4 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTF2Q9UNY4 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTF2Q9UNY4 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTF2Q9UNY4 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTF2Q9UNY4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTF2Q9UNY4 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTF2Q9UNY4 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTF2Q9UNY4 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTF2Q9UNY4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTF2Q9UNY4 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTF2Q9UNY4 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTF2Q9UNY4 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTF2Q9UNY4 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTF2Q9UNY4 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTF2Q9UNY4 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTF2Q9UNY4 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTF2Q9UNY4 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTF2Q9UNY4 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTF2Q9UNY4 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTF2Q9UNY4 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTF2Q9UNY4 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTF2Q9UNY4 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTF2Q9UNY4 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTF2Q9UNY4 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTF2Q9UNY4 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTF2Q9UNY4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTF2Q9UNY4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTF2Q9UNY4 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTF2Q9UNY4 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTF2Q9UNY4 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTF2Q9UNY4 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TTF2Q9UNY4 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTF2Q9UNY4 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTF2Q9UNY4 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTF2Q9UNY4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTF2Q9UNY4 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTF2Q9UNY4 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTF2Q9UNY4 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTF2Q9UNY4 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTF2Q9UNY4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTF2Q9UNY4 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTF2Q9UNY4 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTF2Q9UNY4 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTF2Q9UNY4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTF2Q9UNY4 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTF2Q9UNY4 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTF2Q9UNY4 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTF2Q9UNY4 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTF2Q9UNY4 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TTF2Q9UNY4 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTF2Q9UNY4 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTF2Q9UNY4 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TTF2Q9UNY4 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTF2Q9UNY4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTF2Q9UNY4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTF2Q9UNY4 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTF2Q9UNY4 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTF2Q9UNY4 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTF2Q9UNY4 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTF2Q9UNY4 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTF2Q9UNY4 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTF2Q9UNY4 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTF2Q9UNY4 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTF2Q9UNY4 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTF2Q9UNY4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTF2Q9UNY4 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTF2Q9UNY4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTF2Q9UNY4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTF2Q9UNY4 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTF2Q9UNY4 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TTF2Q9UNY4 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTF2Q9UNY4 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTF2Q9UNY4 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTF2Q9UNY4 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTF2Q9UNY4 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms