Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS6

SYNPO2, Synaptopodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNPO2Q9UMS6 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNPO2Q9UMS6 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNPO2Q9UMS6 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNPO2Q9UMS6 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNPO2Q9UMS6 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNPO2Q9UMS6 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNPO2Q9UMS6 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNPO2Q9UMS6 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNPO2Q9UMS6 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNPO2Q9UMS6 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNPO2Q9UMS6 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNPO2Q9UMS6 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYNPO2Q9UMS6 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYNPO2Q9UMS6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYNPO2Q9UMS6 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYNPO2Q9UMS6 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYNPO2Q9UMS6 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYNPO2Q9UMS6 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYNPO2Q9UMS6 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYNPO2Q9UMS6 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SYNPO2Q9UMS6 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SYNPO2Q9UMS6 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYNPO2Q9UMS6 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SYNPO2Q9UMS6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYNPO2Q9UMS6 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYNPO2Q9UMS6 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYNPO2Q9UMS6 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SYNPO2Q9UMS6 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SYNPO2Q9UMS6 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SYNPO2Q9UMS6 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNPO2Q9UMS6 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNPO2Q9UMS6 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNPO2Q9UMS6 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNPO2Q9UMS6 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNPO2Q9UMS6 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNPO2Q9UMS6 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNPO2Q9UMS6 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNPO2Q9UMS6 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNPO2Q9UMS6 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNPO2Q9UMS6 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNPO2Q9UMS6 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNPO2Q9UMS6 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNPO2Q9UMS6 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNPO2Q9UMS6 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNPO2Q9UMS6 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNPO2Q9UMS6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNPO2Q9UMS6 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNPO2Q9UMS6 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNPO2Q9UMS6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNPO2Q9UMS6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNPO2Q9UMS6 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNPO2Q9UMS6 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNPO2Q9UMS6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNPO2Q9UMS6 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNPO2Q9UMS6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYNPO2Q9UMS6 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYNPO2Q9UMS6 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYNPO2Q9UMS6 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYNPO2Q9UMS6 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYNPO2Q9UMS6 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYNPO2Q9UMS6 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYNPO2Q9UMS6 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SYNPO2Q9UMS6 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYNPO2Q9UMS6 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYNPO2Q9UMS6 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYNPO2Q9UMS6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYNPO2Q9UMS6 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYNPO2Q9UMS6 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNPO2Q9UMS6 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNPO2Q9UMS6 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNPO2Q9UMS6 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNPO2Q9UMS6 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNPO2Q9UMS6 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNPO2Q9UMS6 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNPO2Q9UMS6 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNPO2Q9UMS6 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNPO2Q9UMS6 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNPO2Q9UMS6 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNPO2Q9UMS6 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNPO2Q9UMS6 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNPO2Q9UMS6 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNPO2Q9UMS6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNPO2Q9UMS6 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNPO2Q9UMS6 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNPO2Q9UMS6 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNPO2Q9UMS6 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNPO2Q9UMS6 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNPO2Q9UMS6 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNPO2Q9UMS6 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYNPO2Q9UMS6 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYNPO2Q9UMS6 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYNPO2Q9UMS6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYNPO2Q9UMS6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYNPO2Q9UMS6 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYNPO2Q9UMS6 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYNPO2Q9UMS6 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYNPO2Q9UMS6 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SYNPO2Q9UMS6 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYNPO2Q9UMS6 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SYNPO2Q9UMS6 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms