Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRPF3Q9ULD4 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRPF3Q9ULD4 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRPF3Q9ULD4 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRPF3Q9ULD4 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRPF3Q9ULD4 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRPF3Q9ULD4 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRPF3Q9ULD4 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRPF3Q9ULD4 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRPF3Q9ULD4 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRPF3Q9ULD4 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRPF3Q9ULD4 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRPF3Q9ULD4 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRPF3Q9ULD4 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRPF3Q9ULD4 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRPF3Q9ULD4 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRPF3Q9ULD4 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRPF3Q9ULD4 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRPF3Q9ULD4 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRPF3Q9ULD4 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRPF3Q9ULD4 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRPF3Q9ULD4 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRPF3Q9ULD4 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRPF3Q9ULD4 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRPF3Q9ULD4 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRPF3Q9ULD4 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRPF3Q9ULD4 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRPF3Q9ULD4 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRPF3Q9ULD4 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRPF3Q9ULD4 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRPF3Q9ULD4 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRPF3Q9ULD4 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRPF3Q9ULD4 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRPF3Q9ULD4 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRPF3Q9ULD4 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRPF3Q9ULD4 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRPF3Q9ULD4 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRPF3Q9ULD4 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRPF3Q9ULD4 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRPF3Q9ULD4 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRPF3Q9ULD4 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRPF3Q9ULD4 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRPF3Q9ULD4 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
BRPF3Q9ULD4 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRPF3Q9ULD4 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRPF3Q9ULD4 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRPF3Q9ULD4 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRPF3Q9ULD4 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRPF3Q9ULD4 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
BRPF3Q9ULD4 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRPF3Q9ULD4 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRPF3Q9ULD4 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRPF3Q9ULD4 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRPF3Q9ULD4 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRPF3Q9ULD4 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRPF3Q9ULD4 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
BRPF3Q9ULD4 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRPF3Q9ULD4 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRPF3Q9ULD4 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRPF3Q9ULD4 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRPF3Q9ULD4 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRPF3Q9ULD4 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRPF3Q9ULD4 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BRPF3Q9ULD4 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BRPF3Q9ULD4 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BRPF3Q9ULD4 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BRPF3Q9ULD4 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BRPF3Q9ULD4 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BRPF3Q9ULD4 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BRPF3Q9ULD4 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BRPF3Q9ULD4 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BRPF3Q9ULD4 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
BRPF3Q9ULD4 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BRPF3Q9ULD4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BRPF3Q9ULD4 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BRPF3Q9ULD4 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BRPF3Q9ULD4 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BRPF3Q9ULD4 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BRPF3Q9ULD4 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
BRPF3Q9ULD4 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
BRPF3Q9ULD4 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
BRPF3Q9ULD4 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
BRPF3Q9ULD4 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
BRPF3Q9ULD4 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
BRPF3Q9ULD4 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
BRPF3Q9ULD4 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRPF3Q9ULD4 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRPF3Q9ULD4 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRPF3Q9ULD4 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRPF3Q9ULD4 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRPF3Q9ULD4 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
BRPF3Q9ULD4 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRPF3Q9ULD4 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRPF3Q9ULD4 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRPF3Q9ULD4 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRPF3Q9ULD4 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRPF3Q9ULD4 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRPF3Q9ULD4 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRPF3Q9ULD4 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRPF3Q9ULD4 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms