Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL42

PNMA2, Paraneoplastic antigen Ma2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA2Q9UL42 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PNMA2Q9UL42 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PNMA2Q9UL42 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PNMA2Q9UL42 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PNMA2Q9UL42 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PNMA2Q9UL42 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PNMA2Q9UL42 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PNMA2Q9UL42 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PNMA2Q9UL42 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PNMA2Q9UL42 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PNMA2Q9UL42 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PNMA2Q9UL42 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PNMA2Q9UL42 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PNMA2Q9UL42 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PNMA2Q9UL42 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PNMA2Q9UL42 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PNMA2Q9UL42 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PNMA2Q9UL42 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PNMA2Q9UL42 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PNMA2Q9UL42 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PNMA2Q9UL42 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PNMA2Q9UL42 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PNMA2Q9UL42 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PNMA2Q9UL42 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PNMA2Q9UL42 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PNMA2Q9UL42 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PNMA2Q9UL42 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PNMA2Q9UL42 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PNMA2Q9UL42 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PNMA2Q9UL42 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PNMA2Q9UL42 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PNMA2Q9UL42 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PNMA2Q9UL42 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PNMA2Q9UL42 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PNMA2Q9UL42 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PNMA2Q9UL42 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PNMA2Q9UL42 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PNMA2Q9UL42 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PNMA2Q9UL42 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PNMA2Q9UL42 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PNMA2Q9UL42 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PNMA2Q9UL42 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PNMA2Q9UL42 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PNMA2Q9UL42 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PNMA2Q9UL42 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PNMA2Q9UL42 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PNMA2Q9UL42 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PNMA2Q9UL42 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PNMA2Q9UL42 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PNMA2Q9UL42 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PNMA2Q9UL42 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PNMA2Q9UL42 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PNMA2Q9UL42 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PNMA2Q9UL42 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PNMA2Q9UL42 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PNMA2Q9UL42 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PNMA2Q9UL42 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PNMA2Q9UL42 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PNMA2Q9UL42 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PNMA2Q9UL42 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PNMA2Q9UL42 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PNMA2Q9UL42 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PNMA2Q9UL42 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PNMA2Q9UL42 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PNMA2Q9UL42 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PNMA2Q9UL42 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PNMA2Q9UL42 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PNMA2Q9UL42 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PNMA2Q9UL42 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PNMA2Q9UL42 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PNMA2Q9UL42 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PNMA2Q9UL42 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PNMA2Q9UL42 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PNMA2Q9UL42 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PNMA2Q9UL42 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PNMA2Q9UL42 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PNMA2Q9UL42 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PNMA2Q9UL42 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PNMA2Q9UL42 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PNMA2Q9UL42 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PNMA2Q9UL42 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PNMA2Q9UL42 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PNMA2Q9UL42 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PNMA2Q9UL42 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PNMA2Q9UL42 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PNMA2Q9UL42 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PNMA2Q9UL42 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PNMA2Q9UL42 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PNMA2Q9UL42 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PNMA2Q9UL42 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PNMA2Q9UL42 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PNMA2Q9UL42 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PNMA2Q9UL42 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PNMA2Q9UL42 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PNMA2Q9UL42 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PNMA2Q9UL42 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PNMA2Q9UL42 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PNMA2Q9UL42 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PNMA2Q9UL42 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PNMA2Q9UL42 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms