Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PACSIN3Q9UKS6 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PACSIN3Q9UKS6 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PACSIN3Q9UKS6 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PACSIN3Q9UKS6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PACSIN3Q9UKS6 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PACSIN3Q9UKS6 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PACSIN3Q9UKS6 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PACSIN3Q9UKS6 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PACSIN3Q9UKS6 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PACSIN3Q9UKS6 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PACSIN3Q9UKS6 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PACSIN3Q9UKS6 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PACSIN3Q9UKS6 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PACSIN3Q9UKS6 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PACSIN3Q9UKS6 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PACSIN3Q9UKS6 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PACSIN3Q9UKS6 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PACSIN3Q9UKS6 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PACSIN3Q9UKS6 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PACSIN3Q9UKS6 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PACSIN3Q9UKS6 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PACSIN3Q9UKS6 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PACSIN3Q9UKS6 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PACSIN3Q9UKS6 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PACSIN3Q9UKS6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PACSIN3Q9UKS6 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
PACSIN3Q9UKS6 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PACSIN3Q9UKS6 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PACSIN3Q9UKS6 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PACSIN3Q9UKS6 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PACSIN3Q9UKS6 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PACSIN3Q9UKS6 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
PACSIN3Q9UKS6 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PACSIN3Q9UKS6 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PACSIN3Q9UKS6 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PACSIN3Q9UKS6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PACSIN3Q9UKS6 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PACSIN3Q9UKS6 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PACSIN3Q9UKS6 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
PACSIN3Q9UKS6 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PACSIN3Q9UKS6 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PACSIN3Q9UKS6 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PACSIN3Q9UKS6 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PACSIN3Q9UKS6 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PACSIN3Q9UKS6 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PACSIN3Q9UKS6 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PACSIN3Q9UKS6 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PACSIN3Q9UKS6 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PACSIN3Q9UKS6 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PACSIN3Q9UKS6 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PACSIN3Q9UKS6 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PACSIN3Q9UKS6 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PACSIN3Q9UKS6 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PACSIN3Q9UKS6 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PACSIN3Q9UKS6 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PACSIN3Q9UKS6 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PACSIN3Q9UKS6 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PACSIN3Q9UKS6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PACSIN3Q9UKS6 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PACSIN3Q9UKS6 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PACSIN3Q9UKS6 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
PACSIN3Q9UKS6 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PACSIN3Q9UKS6 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PACSIN3Q9UKS6 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PACSIN3Q9UKS6 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PACSIN3Q9UKS6 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PACSIN3Q9UKS6 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PACSIN3Q9UKS6 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PACSIN3Q9UKS6 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PACSIN3Q9UKS6 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PACSIN3Q9UKS6 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PACSIN3Q9UKS6 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PACSIN3Q9UKS6 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PACSIN3Q9UKS6 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PACSIN3Q9UKS6 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PACSIN3Q9UKS6 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PACSIN3Q9UKS6 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PACSIN3Q9UKS6 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PACSIN3Q9UKS6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PACSIN3Q9UKS6 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PACSIN3Q9UKS6 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PACSIN3Q9UKS6 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PACSIN3Q9UKS6 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PACSIN3Q9UKS6 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PACSIN3Q9UKS6 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PACSIN3Q9UKS6 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PACSIN3Q9UKS6 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PACSIN3Q9UKS6 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PACSIN3Q9UKS6 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PACSIN3Q9UKS6 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PACSIN3Q9UKS6 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PACSIN3Q9UKS6 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PACSIN3Q9UKS6 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PACSIN3Q9UKS6 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PACSIN3Q9UKS6 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PACSIN3Q9UKS6 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PACSIN3Q9UKS6 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PACSIN3Q9UKS6 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PACSIN3Q9UKS6 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms