Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBE1Q9UJT0 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBE1Q9UJT0 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBE1Q9UJT0 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBE1Q9UJT0 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBE1Q9UJT0 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBE1Q9UJT0 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBE1Q9UJT0 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBE1Q9UJT0 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBE1Q9UJT0 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBE1Q9UJT0 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBE1Q9UJT0 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBE1Q9UJT0 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBE1Q9UJT0 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBE1Q9UJT0 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBE1Q9UJT0 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBE1Q9UJT0 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBE1Q9UJT0 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBE1Q9UJT0 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBE1Q9UJT0 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBE1Q9UJT0 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBE1Q9UJT0 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBE1Q9UJT0 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBE1Q9UJT0 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBE1Q9UJT0 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBE1Q9UJT0 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBE1Q9UJT0 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBE1Q9UJT0 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBE1Q9UJT0 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBE1Q9UJT0 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBE1Q9UJT0 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBE1Q9UJT0 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBE1Q9UJT0 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBE1Q9UJT0 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBE1Q9UJT0 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBE1Q9UJT0 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBE1Q9UJT0 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBE1Q9UJT0 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBE1Q9UJT0 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBE1Q9UJT0 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBE1Q9UJT0 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBE1Q9UJT0 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBE1Q9UJT0 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBE1Q9UJT0 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBE1Q9UJT0 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBE1Q9UJT0 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBE1Q9UJT0 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBE1Q9UJT0 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBE1Q9UJT0 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBE1Q9UJT0 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBE1Q9UJT0 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBE1Q9UJT0 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBE1Q9UJT0 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBE1Q9UJT0 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBE1Q9UJT0 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBE1Q9UJT0 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBE1Q9UJT0 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBE1Q9UJT0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBE1Q9UJT0 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBE1Q9UJT0 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBE1Q9UJT0 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBE1Q9UJT0 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBE1Q9UJT0 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBE1Q9UJT0 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBE1Q9UJT0 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBE1Q9UJT0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBE1Q9UJT0 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBE1Q9UJT0 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBE1Q9UJT0 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBE1Q9UJT0 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBE1Q9UJT0 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBE1Q9UJT0 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBE1Q9UJT0 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBE1Q9UJT0 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBE1Q9UJT0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBE1Q9UJT0 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBE1Q9UJT0 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBE1Q9UJT0 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBE1Q9UJT0 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBE1Q9UJT0 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBE1Q9UJT0 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBE1Q9UJT0 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBE1Q9UJT0 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBE1Q9UJT0 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBE1Q9UJT0 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBE1Q9UJT0 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBE1Q9UJT0 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBE1Q9UJT0 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBE1Q9UJT0 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBE1Q9UJT0 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBE1Q9UJT0 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBE1Q9UJT0 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBE1Q9UJT0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBE1Q9UJT0 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBE1Q9UJT0 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBE1Q9UJT0 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBE1Q9UJT0 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBE1Q9UJT0 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBE1Q9UJT0 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBE1Q9UJT0 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms