Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIK5

TMEFF2, Tomoregulin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEFF2Q9UIK5 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEFF2Q9UIK5 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEFF2Q9UIK5 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEFF2Q9UIK5 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEFF2Q9UIK5 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEFF2Q9UIK5 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEFF2Q9UIK5 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEFF2Q9UIK5 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEFF2Q9UIK5 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEFF2Q9UIK5 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEFF2Q9UIK5 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEFF2Q9UIK5 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEFF2Q9UIK5 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEFF2Q9UIK5 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEFF2Q9UIK5 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEFF2Q9UIK5 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEFF2Q9UIK5 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEFF2Q9UIK5 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEFF2Q9UIK5 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEFF2Q9UIK5 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEFF2Q9UIK5 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEFF2Q9UIK5 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEFF2Q9UIK5 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEFF2Q9UIK5 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEFF2Q9UIK5 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEFF2Q9UIK5 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEFF2Q9UIK5 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEFF2Q9UIK5 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEFF2Q9UIK5 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEFF2Q9UIK5 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEFF2Q9UIK5 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEFF2Q9UIK5 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEFF2Q9UIK5 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEFF2Q9UIK5 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEFF2Q9UIK5 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEFF2Q9UIK5 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEFF2Q9UIK5 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEFF2Q9UIK5 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEFF2Q9UIK5 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEFF2Q9UIK5 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEFF2Q9UIK5 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEFF2Q9UIK5 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEFF2Q9UIK5 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEFF2Q9UIK5 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEFF2Q9UIK5 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEFF2Q9UIK5 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEFF2Q9UIK5 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEFF2Q9UIK5 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEFF2Q9UIK5 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEFF2Q9UIK5 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEFF2Q9UIK5 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEFF2Q9UIK5 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEFF2Q9UIK5 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEFF2Q9UIK5 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEFF2Q9UIK5 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEFF2Q9UIK5 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEFF2Q9UIK5 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEFF2Q9UIK5 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEFF2Q9UIK5 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEFF2Q9UIK5 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEFF2Q9UIK5 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEFF2Q9UIK5 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEFF2Q9UIK5 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEFF2Q9UIK5 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEFF2Q9UIK5 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEFF2Q9UIK5 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEFF2Q9UIK5 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEFF2Q9UIK5 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEFF2Q9UIK5 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEFF2Q9UIK5 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEFF2Q9UIK5 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEFF2Q9UIK5 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEFF2Q9UIK5 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEFF2Q9UIK5 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEFF2Q9UIK5 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEFF2Q9UIK5 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEFF2Q9UIK5 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEFF2Q9UIK5 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEFF2Q9UIK5 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEFF2Q9UIK5 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEFF2Q9UIK5 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEFF2Q9UIK5 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEFF2Q9UIK5 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEFF2Q9UIK5 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEFF2Q9UIK5 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEFF2Q9UIK5 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEFF2Q9UIK5 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEFF2Q9UIK5 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEFF2Q9UIK5 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEFF2Q9UIK5 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEFF2Q9UIK5 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEFF2Q9UIK5 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEFF2Q9UIK5 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEFF2Q9UIK5 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEFF2Q9UIK5 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEFF2Q9UIK5 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEFF2Q9UIK5 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEFF2Q9UIK5 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEFF2Q9UIK5 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEFF2Q9UIK5 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms