Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI46

DNAI1, Dynein intermediate chain 1, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAI1Q9UI46 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DNAI1Q9UI46 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DNAI1Q9UI46 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DNAI1Q9UI46 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DNAI1Q9UI46 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DNAI1Q9UI46 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DNAI1Q9UI46 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DNAI1Q9UI46 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DNAI1Q9UI46 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DNAI1Q9UI46 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DNAI1Q9UI46 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DNAI1Q9UI46 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DNAI1Q9UI46 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DNAI1Q9UI46 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNAI1Q9UI46 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNAI1Q9UI46 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNAI1Q9UI46 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNAI1Q9UI46 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNAI1Q9UI46 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNAI1Q9UI46 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNAI1Q9UI46 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNAI1Q9UI46 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNAI1Q9UI46 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNAI1Q9UI46 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNAI1Q9UI46 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNAI1Q9UI46 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNAI1Q9UI46 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNAI1Q9UI46 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNAI1Q9UI46 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNAI1Q9UI46 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNAI1Q9UI46 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNAI1Q9UI46 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNAI1Q9UI46 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAI1Q9UI46 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAI1Q9UI46 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAI1Q9UI46 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAI1Q9UI46 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAI1Q9UI46 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAI1Q9UI46 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAI1Q9UI46 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAI1Q9UI46 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAI1Q9UI46 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAI1Q9UI46 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAI1Q9UI46 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAI1Q9UI46 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAI1Q9UI46 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAI1Q9UI46 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAI1Q9UI46 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAI1Q9UI46 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAI1Q9UI46 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAI1Q9UI46 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAI1Q9UI46 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAI1Q9UI46 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAI1Q9UI46 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAI1Q9UI46 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAI1Q9UI46 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAI1Q9UI46 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAI1Q9UI46 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAI1Q9UI46 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAI1Q9UI46 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAI1Q9UI46 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAI1Q9UI46 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAI1Q9UI46 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAI1Q9UI46 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAI1Q9UI46 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAI1Q9UI46 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAI1Q9UI46 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAI1Q9UI46 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAI1Q9UI46 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAI1Q9UI46 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAI1Q9UI46 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DNAI1Q9UI46 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DNAI1Q9UI46 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNAI1Q9UI46 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNAI1Q9UI46 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNAI1Q9UI46 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNAI1Q9UI46 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNAI1Q9UI46 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNAI1Q9UI46 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNAI1Q9UI46 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNAI1Q9UI46 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNAI1Q9UI46 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNAI1Q9UI46 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
DNAI1Q9UI46 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNAI1Q9UI46 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNAI1Q9UI46 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNAI1Q9UI46 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNAI1Q9UI46 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNAI1Q9UI46 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNAI1Q9UI46 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNAI1Q9UI46 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNAI1Q9UI46 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNAI1Q9UI46 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAI1Q9UI46 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAI1Q9UI46 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAI1Q9UI46 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAI1Q9UI46 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAI1Q9UI46 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAI1Q9UI46 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAI1Q9UI46 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms