Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHORDC1Q9UHD1 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHORDC1Q9UHD1 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHORDC1Q9UHD1 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHORDC1Q9UHD1 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CHORDC1Q9UHD1 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHORDC1Q9UHD1 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHORDC1Q9UHD1 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHORDC1Q9UHD1 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHORDC1Q9UHD1 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHORDC1Q9UHD1 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHORDC1Q9UHD1 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHORDC1Q9UHD1 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHORDC1Q9UHD1 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CHORDC1Q9UHD1 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CHORDC1Q9UHD1 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CHORDC1Q9UHD1 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CHORDC1Q9UHD1 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHORDC1Q9UHD1 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHORDC1Q9UHD1 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHORDC1Q9UHD1 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHORDC1Q9UHD1 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHORDC1Q9UHD1 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CHORDC1Q9UHD1 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CHORDC1Q9UHD1 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CHORDC1Q9UHD1 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHORDC1Q9UHD1 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHORDC1Q9UHD1 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHORDC1Q9UHD1 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHORDC1Q9UHD1 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHORDC1Q9UHD1 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHORDC1Q9UHD1 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CHORDC1Q9UHD1 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHORDC1Q9UHD1 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHORDC1Q9UHD1 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CHORDC1Q9UHD1 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CHORDC1Q9UHD1 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHORDC1Q9UHD1 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHORDC1Q9UHD1 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHORDC1Q9UHD1 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHORDC1Q9UHD1 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHORDC1Q9UHD1 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHORDC1Q9UHD1 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHORDC1Q9UHD1 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHORDC1Q9UHD1 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHORDC1Q9UHD1 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHORDC1Q9UHD1 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHORDC1Q9UHD1 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHORDC1Q9UHD1 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHORDC1Q9UHD1 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHORDC1Q9UHD1 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHORDC1Q9UHD1 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHORDC1Q9UHD1 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHORDC1Q9UHD1 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHORDC1Q9UHD1 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHORDC1Q9UHD1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHORDC1Q9UHD1 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHORDC1Q9UHD1 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHORDC1Q9UHD1 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHORDC1Q9UHD1 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHORDC1Q9UHD1 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHORDC1Q9UHD1 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHORDC1Q9UHD1 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHORDC1Q9UHD1 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHORDC1Q9UHD1 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHORDC1Q9UHD1 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHORDC1Q9UHD1 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHORDC1Q9UHD1 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHORDC1Q9UHD1 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHORDC1Q9UHD1 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHORDC1Q9UHD1 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHORDC1Q9UHD1 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHORDC1Q9UHD1 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CHORDC1Q9UHD1 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHORDC1Q9UHD1 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHORDC1Q9UHD1 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHORDC1Q9UHD1 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHORDC1Q9UHD1 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHORDC1Q9UHD1 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHORDC1Q9UHD1 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHORDC1Q9UHD1 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHORDC1Q9UHD1 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHORDC1Q9UHD1 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHORDC1Q9UHD1 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHORDC1Q9UHD1 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHORDC1Q9UHD1 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHORDC1Q9UHD1 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHORDC1Q9UHD1 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHORDC1Q9UHD1 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHORDC1Q9UHD1 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHORDC1Q9UHD1 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHORDC1Q9UHD1 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHORDC1Q9UHD1 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHORDC1Q9UHD1 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CHORDC1Q9UHD1 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHORDC1Q9UHD1 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHORDC1Q9UHD1 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHORDC1Q9UHD1 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHORDC1Q9UHD1 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHORDC1Q9UHD1 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms