Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
IFT172Q9UG01 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
IFT172Q9UG01 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
IFT172Q9UG01 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
IFT172Q9UG01 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
IFT172Q9UG01 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
IFT172Q9UG01 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
IFT172Q9UG01 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
IFT172Q9UG01 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
IFT172Q9UG01 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
IFT172Q9UG01 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
IFT172Q9UG01 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
IFT172Q9UG01 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
IFT172Q9UG01 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
IFT172Q9UG01 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
IFT172Q9UG01 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
IFT172Q9UG01 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
IFT172Q9UG01 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
IFT172Q9UG01 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
IFT172Q9UG01 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
IFT172Q9UG01 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
IFT172Q9UG01 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
IFT172Q9UG01 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
IFT172Q9UG01 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
IFT172Q9UG01 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
IFT172Q9UG01 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
IFT172Q9UG01 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
IFT172Q9UG01 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
IFT172Q9UG01 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
IFT172Q9UG01 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
IFT172Q9UG01 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
IFT172Q9UG01 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
IFT172Q9UG01 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
IFT172Q9UG01 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
IFT172Q9UG01 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
IFT172Q9UG01 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC29.01■■■□□ 2.23
IFT172Q9UG01 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
IFT172Q9UG01 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
IFT172Q9UG01 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
IFT172Q9UG01 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
IFT172Q9UG01 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
IFT172Q9UG01 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
IFT172Q9UG01 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
IFT172Q9UG01 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
IFT172Q9UG01 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
IFT172Q9UG01 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
IFT172Q9UG01 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
IFT172Q9UG01 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
IFT172Q9UG01 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
IFT172Q9UG01 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
IFT172Q9UG01 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
IFT172Q9UG01 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
IFT172Q9UG01 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
IFT172Q9UG01 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
IFT172Q9UG01 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
IFT172Q9UG01 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
IFT172Q9UG01 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
IFT172Q9UG01 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
IFT172Q9UG01 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
IFT172Q9UG01 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
IFT172Q9UG01 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC29■■■□□ 2.23
IFT172Q9UG01 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
IFT172Q9UG01 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC29■■■□□ 2.23
IFT172Q9UG01 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
IFT172Q9UG01 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
IFT172Q9UG01 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
IFT172Q9UG01 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
IFT172Q9UG01 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
IFT172Q9UG01 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
IFT172Q9UG01 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
IFT172Q9UG01 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
IFT172Q9UG01 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
IFT172Q9UG01 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
IFT172Q9UG01 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
IFT172Q9UG01 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
IFT172Q9UG01 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
IFT172Q9UG01 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
IFT172Q9UG01 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
IFT172Q9UG01 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
IFT172Q9UG01 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
IFT172Q9UG01 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
IFT172Q9UG01 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
IFT172Q9UG01 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
IFT172Q9UG01 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
IFT172Q9UG01 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
IFT172Q9UG01 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
IFT172Q9UG01 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
IFT172Q9UG01 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
IFT172Q9UG01 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
IFT172Q9UG01 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
IFT172Q9UG01 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
IFT172Q9UG01 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
IFT172Q9UG01 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
IFT172Q9UG01 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
IFT172Q9UG01 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
IFT172Q9UG01 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
IFT172Q9UG01 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
IFT172Q9UG01 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
IFT172Q9UG01 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
IFT172Q9UG01 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms