Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEU0

VTI1B, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1BQ9UEU0 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VTI1BQ9UEU0 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VTI1BQ9UEU0 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VTI1BQ9UEU0 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VTI1BQ9UEU0 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VTI1BQ9UEU0 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VTI1BQ9UEU0 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
VTI1BQ9UEU0 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VTI1BQ9UEU0 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VTI1BQ9UEU0 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VTI1BQ9UEU0 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VTI1BQ9UEU0 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VTI1BQ9UEU0 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
VTI1BQ9UEU0 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VTI1BQ9UEU0 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VTI1BQ9UEU0 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VTI1BQ9UEU0 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VTI1BQ9UEU0 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VTI1BQ9UEU0 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VTI1BQ9UEU0 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VTI1BQ9UEU0 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VTI1BQ9UEU0 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VTI1BQ9UEU0 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VTI1BQ9UEU0 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VTI1BQ9UEU0 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VTI1BQ9UEU0 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VTI1BQ9UEU0 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VTI1BQ9UEU0 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VTI1BQ9UEU0 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VTI1BQ9UEU0 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VTI1BQ9UEU0 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VTI1BQ9UEU0 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VTI1BQ9UEU0 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VTI1BQ9UEU0 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VTI1BQ9UEU0 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VTI1BQ9UEU0 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VTI1BQ9UEU0 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VTI1BQ9UEU0 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VTI1BQ9UEU0 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VTI1BQ9UEU0 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VTI1BQ9UEU0 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
VTI1BQ9UEU0 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VTI1BQ9UEU0 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VTI1BQ9UEU0 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VTI1BQ9UEU0 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VTI1BQ9UEU0 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VTI1BQ9UEU0 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VTI1BQ9UEU0 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VTI1BQ9UEU0 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VTI1BQ9UEU0 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VTI1BQ9UEU0 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VTI1BQ9UEU0 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VTI1BQ9UEU0 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VTI1BQ9UEU0 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VTI1BQ9UEU0 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VTI1BQ9UEU0 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VTI1BQ9UEU0 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VTI1BQ9UEU0 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VTI1BQ9UEU0 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VTI1BQ9UEU0 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VTI1BQ9UEU0 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VTI1BQ9UEU0 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VTI1BQ9UEU0 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VTI1BQ9UEU0 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VTI1BQ9UEU0 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VTI1BQ9UEU0 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VTI1BQ9UEU0 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VTI1BQ9UEU0 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VTI1BQ9UEU0 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VTI1BQ9UEU0 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VTI1BQ9UEU0 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VTI1BQ9UEU0 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VTI1BQ9UEU0 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VTI1BQ9UEU0 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VTI1BQ9UEU0 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VTI1BQ9UEU0 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VTI1BQ9UEU0 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
VTI1BQ9UEU0 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
VTI1BQ9UEU0 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
VTI1BQ9UEU0 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VTI1BQ9UEU0 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
VTI1BQ9UEU0 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VTI1BQ9UEU0 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
VTI1BQ9UEU0 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
VTI1BQ9UEU0 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VTI1BQ9UEU0 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
VTI1BQ9UEU0 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VTI1BQ9UEU0 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VTI1BQ9UEU0 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VTI1BQ9UEU0 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VTI1BQ9UEU0 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
VTI1BQ9UEU0 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VTI1BQ9UEU0 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
VTI1BQ9UEU0 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
VTI1BQ9UEU0 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
VTI1BQ9UEU0 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VTI1BQ9UEU0 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VTI1BQ9UEU0 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VTI1BQ9UEU0 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
VTI1BQ9UEU0 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms