Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX2

DUX4, Double homeobox protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4Q9UBX2 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DUX4Q9UBX2 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DUX4Q9UBX2 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DUX4Q9UBX2 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DUX4Q9UBX2 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DUX4Q9UBX2 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DUX4Q9UBX2 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUX4Q9UBX2 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUX4Q9UBX2 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUX4Q9UBX2 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUX4Q9UBX2 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUX4Q9UBX2 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
DUX4Q9UBX2 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUX4Q9UBX2 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUX4Q9UBX2 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUX4Q9UBX2 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUX4Q9UBX2 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUX4Q9UBX2 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUX4Q9UBX2 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUX4Q9UBX2 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUX4Q9UBX2 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUX4Q9UBX2 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUX4Q9UBX2 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUX4Q9UBX2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUX4Q9UBX2 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUX4Q9UBX2 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUX4Q9UBX2 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUX4Q9UBX2 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUX4Q9UBX2 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUX4Q9UBX2 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUX4Q9UBX2 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUX4Q9UBX2 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUX4Q9UBX2 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUX4Q9UBX2 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUX4Q9UBX2 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUX4Q9UBX2 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUX4Q9UBX2 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUX4Q9UBX2 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUX4Q9UBX2 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUX4Q9UBX2 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUX4Q9UBX2 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUX4Q9UBX2 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUX4Q9UBX2 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUX4Q9UBX2 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUX4Q9UBX2 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUX4Q9UBX2 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUX4Q9UBX2 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUX4Q9UBX2 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUX4Q9UBX2 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUX4Q9UBX2 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUX4Q9UBX2 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUX4Q9UBX2 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUX4Q9UBX2 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUX4Q9UBX2 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUX4Q9UBX2 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUX4Q9UBX2 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DUX4Q9UBX2 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DUX4Q9UBX2 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DUX4Q9UBX2 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DUX4Q9UBX2 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DUX4Q9UBX2 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DUX4Q9UBX2 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DUX4Q9UBX2 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DUX4Q9UBX2 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DUX4Q9UBX2 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DUX4Q9UBX2 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DUX4Q9UBX2 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DUX4Q9UBX2 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
DUX4Q9UBX2 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DUX4Q9UBX2 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DUX4Q9UBX2 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DUX4Q9UBX2 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
DUX4Q9UBX2 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DUX4Q9UBX2 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
DUX4Q9UBX2 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DUX4Q9UBX2 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUX4Q9UBX2 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUX4Q9UBX2 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUX4Q9UBX2 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUX4Q9UBX2 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUX4Q9UBX2 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUX4Q9UBX2 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUX4Q9UBX2 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
DUX4Q9UBX2 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUX4Q9UBX2 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUX4Q9UBX2 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUX4Q9UBX2 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUX4Q9UBX2 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUX4Q9UBX2 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUX4Q9UBX2 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUX4Q9UBX2 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUX4Q9UBX2 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUX4Q9UBX2 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUX4Q9UBX2 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUX4Q9UBX2 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUX4Q9UBX2 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUX4Q9UBX2 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUX4Q9UBX2 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUX4Q9UBX2 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUX4Q9UBX2 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms