Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPASTQ9UBP0 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SPASTQ9UBP0 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPASTQ9UBP0 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPASTQ9UBP0 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPASTQ9UBP0 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPASTQ9UBP0 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPASTQ9UBP0 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPASTQ9UBP0 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPASTQ9UBP0 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPASTQ9UBP0 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPASTQ9UBP0 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPASTQ9UBP0 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SPASTQ9UBP0 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPASTQ9UBP0 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPASTQ9UBP0 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPASTQ9UBP0 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SPASTQ9UBP0 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPASTQ9UBP0 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPASTQ9UBP0 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SPASTQ9UBP0 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPASTQ9UBP0 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPASTQ9UBP0 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPASTQ9UBP0 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPASTQ9UBP0 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPASTQ9UBP0 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPASTQ9UBP0 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPASTQ9UBP0 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPASTQ9UBP0 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPASTQ9UBP0 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPASTQ9UBP0 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPASTQ9UBP0 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPASTQ9UBP0 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPASTQ9UBP0 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPASTQ9UBP0 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPASTQ9UBP0 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPASTQ9UBP0 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPASTQ9UBP0 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPASTQ9UBP0 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPASTQ9UBP0 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SPASTQ9UBP0 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPASTQ9UBP0 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPASTQ9UBP0 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPASTQ9UBP0 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPASTQ9UBP0 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPASTQ9UBP0 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPASTQ9UBP0 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPASTQ9UBP0 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPASTQ9UBP0 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPASTQ9UBP0 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPASTQ9UBP0 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPASTQ9UBP0 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPASTQ9UBP0 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPASTQ9UBP0 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPASTQ9UBP0 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPASTQ9UBP0 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SPASTQ9UBP0 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SPASTQ9UBP0 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPASTQ9UBP0 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPASTQ9UBP0 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPASTQ9UBP0 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPASTQ9UBP0 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPASTQ9UBP0 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPASTQ9UBP0 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPASTQ9UBP0 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPASTQ9UBP0 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPASTQ9UBP0 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPASTQ9UBP0 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPASTQ9UBP0 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPASTQ9UBP0 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPASTQ9UBP0 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPASTQ9UBP0 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPASTQ9UBP0 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPASTQ9UBP0 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPASTQ9UBP0 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPASTQ9UBP0 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPASTQ9UBP0 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPASTQ9UBP0 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPASTQ9UBP0 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPASTQ9UBP0 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPASTQ9UBP0 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPASTQ9UBP0 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPASTQ9UBP0 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPASTQ9UBP0 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPASTQ9UBP0 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPASTQ9UBP0 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPASTQ9UBP0 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPASTQ9UBP0 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPASTQ9UBP0 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPASTQ9UBP0 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPASTQ9UBP0 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPASTQ9UBP0 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPASTQ9UBP0 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPASTQ9UBP0 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPASTQ9UBP0 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPASTQ9UBP0 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPASTQ9UBP0 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPASTQ9UBP0 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPASTQ9UBP0 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPASTQ9UBP0 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms