Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHPF2Q9P2E5 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHPF2Q9P2E5 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHPF2Q9P2E5 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHPF2Q9P2E5 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHPF2Q9P2E5 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHPF2Q9P2E5 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHPF2Q9P2E5 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHPF2Q9P2E5 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHPF2Q9P2E5 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHPF2Q9P2E5 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHPF2Q9P2E5 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHPF2Q9P2E5 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHPF2Q9P2E5 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHPF2Q9P2E5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHPF2Q9P2E5 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHPF2Q9P2E5 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHPF2Q9P2E5 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHPF2Q9P2E5 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHPF2Q9P2E5 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHPF2Q9P2E5 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHPF2Q9P2E5 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHPF2Q9P2E5 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHPF2Q9P2E5 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHPF2Q9P2E5 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHPF2Q9P2E5 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHPF2Q9P2E5 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHPF2Q9P2E5 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHPF2Q9P2E5 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHPF2Q9P2E5 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHPF2Q9P2E5 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHPF2Q9P2E5 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHPF2Q9P2E5 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHPF2Q9P2E5 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHPF2Q9P2E5 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHPF2Q9P2E5 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHPF2Q9P2E5 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHPF2Q9P2E5 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHPF2Q9P2E5 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHPF2Q9P2E5 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHPF2Q9P2E5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHPF2Q9P2E5 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CHPF2Q9P2E5 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHPF2Q9P2E5 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CHPF2Q9P2E5 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHPF2Q9P2E5 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHPF2Q9P2E5 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CHPF2Q9P2E5 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHPF2Q9P2E5 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHPF2Q9P2E5 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHPF2Q9P2E5 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHPF2Q9P2E5 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHPF2Q9P2E5 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHPF2Q9P2E5 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHPF2Q9P2E5 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHPF2Q9P2E5 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHPF2Q9P2E5 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHPF2Q9P2E5 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHPF2Q9P2E5 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHPF2Q9P2E5 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHPF2Q9P2E5 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHPF2Q9P2E5 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHPF2Q9P2E5 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHPF2Q9P2E5 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHPF2Q9P2E5 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHPF2Q9P2E5 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHPF2Q9P2E5 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHPF2Q9P2E5 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHPF2Q9P2E5 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHPF2Q9P2E5 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CHPF2Q9P2E5 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHPF2Q9P2E5 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHPF2Q9P2E5 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHPF2Q9P2E5 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHPF2Q9P2E5 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHPF2Q9P2E5 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHPF2Q9P2E5 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHPF2Q9P2E5 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHPF2Q9P2E5 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHPF2Q9P2E5 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHPF2Q9P2E5 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHPF2Q9P2E5 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHPF2Q9P2E5 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHPF2Q9P2E5 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHPF2Q9P2E5 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHPF2Q9P2E5 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHPF2Q9P2E5 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHPF2Q9P2E5 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHPF2Q9P2E5 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CHPF2Q9P2E5 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHPF2Q9P2E5 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CHPF2Q9P2E5 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHPF2Q9P2E5 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHPF2Q9P2E5 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHPF2Q9P2E5 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHPF2Q9P2E5 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHPF2Q9P2E5 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHPF2Q9P2E5 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHPF2Q9P2E5 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHPF2Q9P2E5 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms