Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E3

ZNFX1, NFX1-type zinc finger-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNFX1Q9P2E3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNFX1Q9P2E3 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNFX1Q9P2E3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNFX1Q9P2E3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNFX1Q9P2E3 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNFX1Q9P2E3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNFX1Q9P2E3 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNFX1Q9P2E3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNFX1Q9P2E3 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNFX1Q9P2E3 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNFX1Q9P2E3 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNFX1Q9P2E3 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNFX1Q9P2E3 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNFX1Q9P2E3 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNFX1Q9P2E3 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNFX1Q9P2E3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNFX1Q9P2E3 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNFX1Q9P2E3 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNFX1Q9P2E3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNFX1Q9P2E3 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNFX1Q9P2E3 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNFX1Q9P2E3 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNFX1Q9P2E3 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNFX1Q9P2E3 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNFX1Q9P2E3 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNFX1Q9P2E3 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNFX1Q9P2E3 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNFX1Q9P2E3 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNFX1Q9P2E3 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNFX1Q9P2E3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNFX1Q9P2E3 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNFX1Q9P2E3 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNFX1Q9P2E3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNFX1Q9P2E3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNFX1Q9P2E3 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNFX1Q9P2E3 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNFX1Q9P2E3 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNFX1Q9P2E3 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNFX1Q9P2E3 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNFX1Q9P2E3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNFX1Q9P2E3 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNFX1Q9P2E3 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNFX1Q9P2E3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNFX1Q9P2E3 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
ZNFX1Q9P2E3 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
ZNFX1Q9P2E3 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNFX1Q9P2E3 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNFX1Q9P2E3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNFX1Q9P2E3 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNFX1Q9P2E3 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNFX1Q9P2E3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNFX1Q9P2E3 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNFX1Q9P2E3 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNFX1Q9P2E3 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNFX1Q9P2E3 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNFX1Q9P2E3 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNFX1Q9P2E3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNFX1Q9P2E3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNFX1Q9P2E3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNFX1Q9P2E3 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNFX1Q9P2E3 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNFX1Q9P2E3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNFX1Q9P2E3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNFX1Q9P2E3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNFX1Q9P2E3 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNFX1Q9P2E3 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNFX1Q9P2E3 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNFX1Q9P2E3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNFX1Q9P2E3 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNFX1Q9P2E3 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNFX1Q9P2E3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNFX1Q9P2E3 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNFX1Q9P2E3 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNFX1Q9P2E3 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNFX1Q9P2E3 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNFX1Q9P2E3 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNFX1Q9P2E3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNFX1Q9P2E3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNFX1Q9P2E3 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNFX1Q9P2E3 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNFX1Q9P2E3 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNFX1Q9P2E3 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNFX1Q9P2E3 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNFX1Q9P2E3 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNFX1Q9P2E3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNFX1Q9P2E3 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNFX1Q9P2E3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNFX1Q9P2E3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNFX1Q9P2E3 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNFX1Q9P2E3 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNFX1Q9P2E3 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNFX1Q9P2E3 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNFX1Q9P2E3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNFX1Q9P2E3 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNFX1Q9P2E3 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNFX1Q9P2E3 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNFX1Q9P2E3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNFX1Q9P2E3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNFX1Q9P2E3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNFX1Q9P2E3 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms