Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTN3Q9P232 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTN3Q9P232 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTN3Q9P232 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTN3Q9P232 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTN3Q9P232 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTN3Q9P232 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTN3Q9P232 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTN3Q9P232 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTN3Q9P232 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTN3Q9P232 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTN3Q9P232 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTN3Q9P232 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTN3Q9P232 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTN3Q9P232 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTN3Q9P232 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTN3Q9P232 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTN3Q9P232 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTN3Q9P232 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTN3Q9P232 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTN3Q9P232 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTN3Q9P232 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTN3Q9P232 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTN3Q9P232 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTN3Q9P232 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTN3Q9P232 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTN3Q9P232 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTN3Q9P232 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTN3Q9P232 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTN3Q9P232 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTN3Q9P232 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTN3Q9P232 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTN3Q9P232 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTN3Q9P232 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTN3Q9P232 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTN3Q9P232 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTN3Q9P232 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTN3Q9P232 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTN3Q9P232 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTN3Q9P232 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTN3Q9P232 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTN3Q9P232 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTN3Q9P232 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTN3Q9P232 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTN3Q9P232 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTN3Q9P232 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTN3Q9P232 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTN3Q9P232 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNTN3Q9P232 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNTN3Q9P232 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNTN3Q9P232 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNTN3Q9P232 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNTN3Q9P232 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNTN3Q9P232 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNTN3Q9P232 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNTN3Q9P232 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNTN3Q9P232 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNTN3Q9P232 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNTN3Q9P232 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNTN3Q9P232 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNTN3Q9P232 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNTN3Q9P232 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNTN3Q9P232 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNTN3Q9P232 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNTN3Q9P232 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNTN3Q9P232 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNTN3Q9P232 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNTN3Q9P232 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNTN3Q9P232 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNTN3Q9P232 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNTN3Q9P232 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNTN3Q9P232 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNTN3Q9P232 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNTN3Q9P232 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNTN3Q9P232 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CNTN3Q9P232 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNTN3Q9P232 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNTN3Q9P232 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNTN3Q9P232 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNTN3Q9P232 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNTN3Q9P232 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNTN3Q9P232 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNTN3Q9P232 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNTN3Q9P232 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNTN3Q9P232 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNTN3Q9P232 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNTN3Q9P232 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNTN3Q9P232 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNTN3Q9P232 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNTN3Q9P232 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNTN3Q9P232 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNTN3Q9P232 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNTN3Q9P232 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNTN3Q9P232 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNTN3Q9P232 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNTN3Q9P232 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNTN3Q9P232 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNTN3Q9P232 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNTN3Q9P232 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNTN3Q9P232 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms